More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2256 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  269  7e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  80.45 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.41 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3335  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2547  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.93 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3119  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 165 aa  97.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  42.42 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 152 aa  94.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  42.42 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  41.67 
 
 		 172 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0368  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.77 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4329  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 173 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4048  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.39 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4418  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.23 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  40.15 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 172 aa  85.9  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  40.15 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  40.15 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2516  putative DNA-binding protein  40.74 
 
 		 571 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.15 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4985  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0980195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.88 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  49.38 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.66 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.55 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.31 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.92 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.5 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  29.85 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  30.47 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  29.69 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  36.21 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  28.91 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  29.85 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  29.1 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  29.1 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  29.1 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  29.1 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  29.1 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  31.16 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  29.13 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  28.91 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  28.91 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  34.95 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  28.91 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  34.95 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.61 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  29.32 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  30.15 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  28.24 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.56 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.07 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.3 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0730  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  34.88 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  29.85 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0647  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  30.6 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  30.6 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  30.6 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  30.6 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  30.6 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  30.6 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  30.6 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  30.6 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  30.6 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.1 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  34.65 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>