138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1056 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  42.14 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  42.14 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  42.14 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  42.14 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  42.14 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  42.14 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  42.14 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  42.14 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  42.14 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.43 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.43 
 
 
143 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.86 
 
 
137 aa  110  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  44.2 
 
 
149 aa  110  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.71 
 
 
140 aa  103  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  39.29 
 
 
143 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.38 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
143 aa  99.4  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.69 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  39.29 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  39.29 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  39.29 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  39.29 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  39.29 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  39.29 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  39.29 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  39.29 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.42 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.1 
 
 
146 aa  97.1  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.44 
 
 
164 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  35.61 
 
 
138 aa  93.6  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  38.73 
 
 
154 aa  93.6  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.73 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.55 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.03 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  38.73 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  38.73 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.03 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  38.73 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  38.73 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  38.73 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  38.73 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.01 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  35.51 
 
 
137 aa  92  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.88 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.5 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.32 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.32 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.32 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.32 
 
 
151 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.35 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  35.51 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.91 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.24 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  34.53 
 
 
139 aa  84.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  35.42 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  34.85 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2464  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.14 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000267209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  30.5 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.93 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  36.92 
 
 
141 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.09 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.88 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  38 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.09 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.84 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.1 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.58 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.88 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3335  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.84 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659852  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  28.47 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  27.74 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.43 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0694  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0238705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.76 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  27.01 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.21 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  27.01 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  27.01 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  27.01 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.83 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  27.01 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.6 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  27.01 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  26.28 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.08 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  30.83 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.05 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3119  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.61 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  33.6 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.82 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  33.6 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.08 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.5 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.12 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.5 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.97 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.34 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.43 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0641  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.78 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.974192 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>