235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1088 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  298  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  99.34 
 
 
151 aa  298  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  92.05 
 
 
151 aa  253  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  91.39 
 
 
151 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  91.39 
 
 
151 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  91.39 
 
 
151 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  91.39 
 
 
151 aa  248  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  91.28 
 
 
154 aa  244  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  91.03 
 
 
153 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  91.03 
 
 
153 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  91.03 
 
 
153 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  91.03 
 
 
153 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  91.03 
 
 
153 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  91.03 
 
 
153 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  89.47 
 
 
141 aa  213  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  76.47 
 
 
164 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  79.47 
 
 
151 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  78.81 
 
 
151 aa  206  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  58.74 
 
 
140 aa  149  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  56.34 
 
 
143 aa  146  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.17 
 
 
144 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.08 
 
 
144 aa  140  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.98 
 
 
148 aa  127  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 
151 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.32 
 
 
148 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  48.23 
 
 
149 aa  118  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  48.3 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  48.3 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  48.3 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  48.3 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  48.3 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  48.3 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  48.3 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  48.3 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  48.3 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.93 
 
 
141 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.93 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.76 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  54.41 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  42.36 
 
 
143 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  45.45 
 
 
143 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  45.45 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  45.45 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  45.45 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  45.45 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  45.45 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  45.45 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  45.45 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.96 
 
 
150 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.7 
 
 
143 aa  103  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.73 
 
 
150 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.41 
 
 
148 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  41.35 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  40.43 
 
 
139 aa  97.4  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.06 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.15 
 
 
136 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.52 
 
 
140 aa  93.6  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  38.81 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.69 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.5 
 
 
139 aa  92  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.46 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.84 
 
 
151 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  41.84 
 
 
152 aa  89.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.12 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.4 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  35.29 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.57 
 
 
173 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.81 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  36.96 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.31 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4418  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.59 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.97 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4048  hypothetical protein  32.59 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.56 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  34.46 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  34.46 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.42 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.42 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.37 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.85 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.86 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.72 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.65 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.56 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  31.33 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.37 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  32.45 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  31.33 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  31.33 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  31.33 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2464  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.22 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000267209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  33.11 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2547  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.03 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2516  putative DNA-binding protein  32.45 
 
 
571 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.59 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  30.22 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  31.85 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>