235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4008 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.14 
 
 		 140 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.14 
 
 		 150 aa  89.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 148 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.88 
 
 		 136 aa  85.1  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  40.15 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.77 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.81 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  35.04 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  38.41 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  33.33 
 
 		 149 aa  72  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  37.68 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  37.68 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  37.68 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  37.68 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  35.86 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  35.86 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  35.86 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  35.86 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  35.86 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  35.86 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  35.86 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  35.86 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  35.86 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  26.57 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 143 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3119  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.68 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.93 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0641  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.63 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  27.66 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  25.87 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  25.87 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  25.87 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  25.87 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0624  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.25 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  0.570271 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  25.87 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  25.87 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  25.87 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  25.87 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.63 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.05 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.21 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2516  putative DNA-binding protein  28.68 
 
 		 571 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.85 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3335  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  27.78 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  28.68 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 161 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  27.46 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.99 
 
 		 151 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.41 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1753  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  36.5 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  27.14 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  36.15 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  27.14 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  27.14 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4048  hypothetical protein  30.15 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  27.14 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  27.14 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  27.14 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  27.14 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  28.15 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>