More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2073 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
144 aa  281  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  78.47 
 
 
144 aa  226  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  74.65 
 
 
143 aa  201  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  57.93 
 
 
151 aa  147  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  57.24 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  56.03 
 
 
154 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.17 
 
 
151 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.1 
 
 
164 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  56.12 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  56.12 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  56.12 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  56.12 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  56.12 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  56.12 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.17 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.48 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.48 
 
 
151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.79 
 
 
151 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.79 
 
 
151 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.79 
 
 
151 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  53.96 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.53 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  45 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.06 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  45 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  45 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  45 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  45 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  45 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  45 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  45 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  45 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  56.03 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.57 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.07 
 
 
143 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.26 
 
 
148 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.65 
 
 
137 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  44.06 
 
 
149 aa  104  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.67 
 
 
136 aa  103  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.65 
 
 
151 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.09 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.91 
 
 
141 aa  97.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.36 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  47.1 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.16 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  39.01 
 
 
139 aa  93.6  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  39.01 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  39.01 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  39.01 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  39.01 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  39.01 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  39.01 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  39.01 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  39.01 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  38.3 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.03 
 
 
148 aa  92  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.17 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.3 
 
 
143 aa  90.1  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  37.41 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  36.69 
 
 
138 aa  84.7  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.72 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.58 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.86 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.27 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.42 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.85 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.88 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  35.34 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  30.66 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  30.66 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.35 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.93 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.61 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.17 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.79 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.2 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.62 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.29 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.06 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2547  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.1 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.51 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.66 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  32.58 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.09 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.58 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.47 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.43 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.09 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2516  putative DNA-binding protein  29.37 
 
 
571 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  28.47 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.81 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  28.67 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  28.67 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  28.67 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  28.67 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.01 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  28.67 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  28.67 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>