165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3948 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  279  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  91.24 
 
 		 146 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2547  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  89.05 
 
 		 163 aa  247  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  89.78 
 
 		 146 aa  246  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  62.6 
 
 		 172 aa  167  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  62.6 
 
 		 153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  62.6 
 
 		 172 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  62.6 
 
 		 153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  62.6 
 
 		 153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  62.6 
 
 		 153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2516  putative DNA-binding protein  62.6 
 
 		 571 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  61.03 
 
 		 151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  61.83 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  61.03 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  53.73 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0368  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  57.94 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4418  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  52.24 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 161 aa  147  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  52.55 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4048  hypothetical protein  52.24 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  55.04 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  55.04 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  52.71 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3119  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 165 aa  133  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 173 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3335  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.1 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4329  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  46.22 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.6 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.44 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4985  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0980195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.29 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.04 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.86 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  34.96 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  34.19 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.64 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  34.19 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  37.61 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  37.61 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  37.61 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  37.61 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  37.61 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  37.61 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  37.61 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  37.61 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  37.61 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  30.83 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  45.71 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.96 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  36.8 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  36.8 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  36.8 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  36.8 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  36.8 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  36.8 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  38.05 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  31.87 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.75 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  36 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  35.24 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  32.73 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.24 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>