160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0801 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  288  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  55.4 
 
 
138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  50.72 
 
 
137 aa  144  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.27 
 
 
140 aa  130  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.32 
 
 
137 aa  124  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  38.73 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  38.03 
 
 
143 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  38.03 
 
 
143 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  38.03 
 
 
143 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  38.03 
 
 
143 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  38.03 
 
 
143 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  38.03 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  37.86 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  38.03 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  41.84 
 
 
149 aa  111  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.97 
 
 
143 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  35.97 
 
 
143 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  35.97 
 
 
143 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  35.97 
 
 
143 aa  110  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  35.97 
 
 
143 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  35.97 
 
 
143 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  35.97 
 
 
143 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  35.97 
 
 
143 aa  110  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  35.97 
 
 
143 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  35.97 
 
 
143 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.97 
 
 
143 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  37.04 
 
 
139 aa  110  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.71 
 
 
151 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.69 
 
 
143 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.62 
 
 
146 aa  104  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.88 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.41 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.51 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.28 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2464  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.57 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000267209  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.58 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.03 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.8 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0694  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.09 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0238705  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  32.64 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.8 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.8 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.8 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.5 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.16 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.5 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  33.82 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.21 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.5 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.82 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.82 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.94 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  33.09 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  33.09 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  33.09 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  33.09 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  33.09 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  33.09 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.34 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.61 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.67 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  27.41 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.59 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.71 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.62 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.88 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  34.15 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.17 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.66 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.85 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  27.66 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4048  hypothetical protein  30.66 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3119  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.43 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.17 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4418  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.66 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0097  putative transcriptional regulator  34.44 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.85 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.3 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.83 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.48 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.08 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3335  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.26 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.27 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0183  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.3 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.83 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.1 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.88 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.79 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.79 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1753  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  34.97 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0368  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.87 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.172949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.71 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.77 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>