212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2406 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  68.92 
 
 		 148 aa  216  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  55.07 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  55.07 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  55.07 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  55.07 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  55.07 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  55.07 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  54.35 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  53.19 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  46.38 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  53.6 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  46.97 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  46.97 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  46.97 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.52 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.18 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  40.29 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.48 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  39.26 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  39.26 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  38.52 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  38.52 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  38.52 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  38.52 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  38.52 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  38.52 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  38.52 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  38.73 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  37.68 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.12 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  40.58 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.3 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  36.5 
 
 		 187 aa  73.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.62 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.15 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  34.97 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2464  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.86 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000267209  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2547  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 159 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  30.43 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.96 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  30.43 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.61 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  29.32 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  29.32 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  29.32 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.93 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.88 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  29.32 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  29.32 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  29.32 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.71 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  31.16 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.35 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1893  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>