More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2816 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  47.01 
 
 		 137 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  46.27 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  46.27 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  45.52 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  45.52 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  45.52 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  45.52 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  45.52 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  44.03 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.84 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  31.16 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  31.16 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  31.16 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  31.16 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  31.16 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  31.16 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  31.16 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  31.16 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  31.16 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.12 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  31.85 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.3 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  33.85 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  30.66 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0618  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.09 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0633  hypothetical protein  27.21 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1753  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.11 
 
 		 146 aa  66.6  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0243  hypothetical protein  24.26 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  31.62 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.58 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0624  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.81 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  0.570271 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  27.41 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.63 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1906  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.15 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000482606  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  27.69 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1364  transcriptional regulator, Rrf2 family  31.62 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000386131  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2464  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.35 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000267209  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1748  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.98 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  29.63 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  31.73 
 
 		 492 aa  57  0.00000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.54 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  29.63 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 533 aa  56.2  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  29.63 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  29.63 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  29.63 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2618  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0779  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.68 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.133557  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0360  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.42 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000032246  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1928  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.439593  hitchhiker  0.00175211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3335  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1730  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.00066e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1445  iron-responsive transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2034  Rrf2 family protein (putative transcriptional regulator)  28.21 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0341  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.4 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0800800000000001e-33 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  29.69 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.13 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  29.41 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0694  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0238705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>