More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1748 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1748  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
142 aa  284  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1598  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.93 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000262092  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.07 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.371305  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1940  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.06 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0485  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.9 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0373904  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  31.06 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  31.06 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0683  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.29 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000630574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  31.06 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  31.06 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3812  transcriptional regulator, Rrf2 family  39.22 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2009  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.07 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1168  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.46 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000039809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1277  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.1 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2097  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.5 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.77 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2184  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.85 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0830  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.03 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.6836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1241  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0019006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1906  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.71 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000482606  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0538  hypothetical protein  33.06 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209147  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  34.82 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.47 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1366  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.36 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1265  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.36 
 
 
160 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1300  hypothetical protein  30.77 
 
 
186 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.46 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2583  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.36 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.293791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1607  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.89 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.690617  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.55 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.98 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  31.91 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0503  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.6 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.715595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2010  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.06 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0640  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.32 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.66 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.65 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.01 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.339527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  31.91 
 
 
168 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.63 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1730  transcriptional regulator  30.3 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.00066e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.11 
 
 
184 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0534  Rrf2 family protein  35.58 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000152989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1639  Rrf2 family protein  32.73 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2164  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.43 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000101301  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.71 
 
 
167 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01670  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  33.09 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01054  hypothetical protein  32.2 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.83 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.47 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.83 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2618  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.83 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  24.44 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  31.21 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  31.21 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.15 
 
 
133 aa  57.8  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000720218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0779  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.46 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.133557  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1477  transcriptional regulator  30.7 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000903264  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0730  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.14 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1077  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.93 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.333641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3908  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.68 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000530903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1981  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.2 
 
 
168 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.119158  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.93 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2841  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.12 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000215592  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0788  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.15 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.69 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3240  Rrf2 family protein  28.12 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000396914  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1128  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.13 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3061  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.87 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.325314  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.93 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  32.43 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1973  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.83 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.88 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  30.77 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  30.77 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  30.77 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.82 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.67 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1023  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.73 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.83 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  27.69 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.32 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.88 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  27.01 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  26.52 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1775  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.77 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175223  hitchhiker  0.000151325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1206  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.9 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00151678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1529  hypothetical protein  33.73 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582801  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1843  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.69 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2937  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.48 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000510379  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0829  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.35 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1648  Iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  29.91 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.223295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0423  transcriptional regulator  28.46 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0961866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  30 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>