More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_2769 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  100 
 
 
133 aa  275  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  100 
 
 
133 aa  275  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  97.74 
 
 
133 aa  269  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  96.99 
 
 
133 aa  268  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  94.74 
 
 
133 aa  262  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  67.46 
 
 
126 aa  174  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0683  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.1 
 
 
164 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000630574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  37.84 
 
 
168 aa  104  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  37.58 
 
 
168 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  37.84 
 
 
168 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  37.84 
 
 
168 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3967  transcriptional regulator  36.36 
 
 
174 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29300  putative transcriptional regulator  34.97 
 
 
174 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2937  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.72 
 
 
173 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675377  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3061  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.05 
 
 
162 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.325314  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.24 
 
 
180 aa  96.7  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2120  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.66 
 
 
179 aa  95.9  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.97 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40 
 
 
167 aa  95.1  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2271  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.97 
 
 
179 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448582  normal  0.516915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.9 
 
 
179 aa  94  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1375  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.57 
 
 
165 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2361  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.57 
 
 
179 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55927  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10320  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.84 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.63 
 
 
136 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.79 
 
 
180 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.51 
 
 
184 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0154  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.51 
 
 
168 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1265  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.09 
 
 
160 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1366  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.09 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2583  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.09 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.293791  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0200  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.69 
 
 
166 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.234084  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4312  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.91 
 
 
191 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.784229  normal  0.0976927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1277  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.34 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.35 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.85 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.88 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0230  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.81 
 
 
166 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.32 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2009  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.35 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.06 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.17 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01670  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  31.21 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.85 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.91 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.47 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3908  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.87 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000530903  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.91 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1261  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.62 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.08 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0612  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.78 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0423  transcriptional regulator  31.06 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0961866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2054  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0829  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.83 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.65 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000242173  normal  0.835381 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1452  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.63 
 
 
273 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.78 
 
 
200 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0339289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4000  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.28 
 
 
178 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269761  normal  0.0270518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0538  hypothetical protein  36.17 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209147  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0360  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000032246  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2145  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.87 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000992701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2259  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.38 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0935  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.52 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3300  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.38 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00214095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1637  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.87 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2442  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.17 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1906  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.23 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000482606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5746  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.7 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0341  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0800800000000001e-33 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  32.48 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  32.48 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  32.48 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  32.48 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  30.83 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1241  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.82 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0019006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0485  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.77 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0373904  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2141  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.17 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.426314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  26.72 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  0.0000000282304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0779  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.29 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.133557  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  31.62 
 
 
164 aa  67  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  24.24 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1266  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1002  transcriptional regulator, TrmB  33.7 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283031 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1748  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.06 
 
 
142 aa  66.6  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5208  transcriptional regulator protein-like protein  37.93 
 
 
154 aa  66.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660583  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2269  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.09 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1730  transcriptional regulator  30.19 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.00066e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2989  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.7 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.2519e-18  normal  0.394533 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2028  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.5 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0111127  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2372  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.46 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1598  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.66 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000262092  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.89 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262259  normal  0.12537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4419  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.01 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1204  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.46 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.351528  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0921  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.27 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.343392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>