More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0612 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0612  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
155 aa  308  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  71.24 
 
 
169 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9039  putative transcriptional regulator  72.26 
 
 
157 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5746  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  67.74 
 
 
160 aa  212  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.08 
 
 
162 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.48 
 
 
159 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.53 
 
 
158 aa  121  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.86 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36381 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.86 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.86 
 
 
177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0230  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.84 
 
 
166 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.52 
 
 
162 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01670  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  40.41 
 
 
156 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2054  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.48 
 
 
169 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.74 
 
 
162 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2876  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.61 
 
 
159 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0154  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.38 
 
 
168 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.55 
 
 
162 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0200  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.43 
 
 
166 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.234084  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  39.72 
 
 
169 aa  101  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1261  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.94 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453217  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.36 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  31.21 
 
 
168 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  31.21 
 
 
168 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  29.94 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  29.94 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2937  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675377  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.91 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3967  transcriptional regulator  33.33 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2120  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.86 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2361  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.01 
 
 
179 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55927  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.78 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4312  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.53 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.784229  normal  0.0976927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29300  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.91 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2271  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.72 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448582  normal  0.516915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  34.78 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  34.78 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  34.78 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.65 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.48 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  33.7 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.54 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.78 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.32 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0339289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.87 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3061  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.21 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.325314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1931  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.04 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501375  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10320  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.89 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1002  transcriptional regulator, TrmB  34.53 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01980  Rrf2 family protein  35.25 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491455  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0540  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.45 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2164  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.78 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000101301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1241  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.78 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0019006  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3111  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.14 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.409836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3369  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.21 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105559 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0730  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.6 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4515  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.47 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.103667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1639  Rrf2 family protein  35.87 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  33.6 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1375  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.35 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1268  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.78 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000462831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3015  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.78 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2009  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2059  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1168  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000039809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0788  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  23.4 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1232  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.58 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.618772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.43 
 
 
148 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113346  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5475  hypothetical protein  29.29 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0191  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.47 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1826  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.27 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.46 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1598  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.1 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000262092  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0538  hypothetical protein  32.17 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209147  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0074  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.35 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216243  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  28.67 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4174  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.36 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  30.67 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0963  RrF2 family protein, putative  25.9 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1028  putative RrF2 family protein  25.9 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0891  RrF2 family protein, putative  25.9 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.94 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000720218  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0942  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  23.02 
 
 
134 aa  58.5  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.096782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1607  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.59 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.690617  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0389  iron-responsive transcriptional regulator  27.4 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00187363  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.79 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0683  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.47 
 
 
164 aa  57.8  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000630574  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0830  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25 
 
 
137 aa  57.8  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.6836  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0194  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.53 
 
 
146 aa  57.4  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.14 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1265  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.43 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4135  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255829  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2583  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.43 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.293791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0346  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.01 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000103299  hitchhiker  0.0000140959 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1366  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.43 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0779  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.94 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.133557  normal  0.384095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>