More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0200 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0200  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
166 aa  332  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.234084  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0230  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  90.96 
 
 
166 aa  310  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0154  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  67.27 
 
 
168 aa  219  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2054  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  60.49 
 
 
169 aa  190  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.45 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2876  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50.7 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.93 
 
 
162 aa  121  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.79 
 
 
162 aa  121  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.38 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.26 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.53 
 
 
162 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01670  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  43.66 
 
 
156 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.54 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.66 
 
 
164 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.66 
 
 
161 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3061  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.26 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.325314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  39.74 
 
 
168 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.31 
 
 
167 aa  104  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  39.74 
 
 
168 aa  104  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  39.1 
 
 
168 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  39.1 
 
 
168 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  38.36 
 
 
169 aa  103  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0612  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.43 
 
 
155 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5746  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.15 
 
 
160 aa  98.2  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10320  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.78 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1261  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.86 
 
 
136 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.15 
 
 
169 aa  95.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.86 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9039  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 
157 aa  87.8  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.71 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  37.41 
 
 
133 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  36.69 
 
 
133 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  36.69 
 
 
133 aa  84  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  36.69 
 
 
133 aa  84  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.13 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.03 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.78 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.99 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0683  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.16 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000630574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0779  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.04 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.133557  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.5 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000242173  normal  0.835381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3967  transcriptional regulator  38.85 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1375  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.1 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2937  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.46 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675377  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.22 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29300  putative transcriptional regulator  37.41 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2120  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.55 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.67 
 
 
143 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.371305  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2361  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.32 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55927  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.31 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.57 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2271  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.21 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448582  normal  0.516915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4312  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.64 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.784229  normal  0.0976927 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.94 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0540  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.66 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2009  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.63 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  31.39 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0830  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.86 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.6836  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35 
 
 
200 aa  63.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0339289 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0538  hypothetical protein  38.04 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209147  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.87 
 
 
136 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1607  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.99 
 
 
144 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.690617  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1300  hypothetical protein  35.87 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  31.39 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0485  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.56 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0373904  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  31.39 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  32.12 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  32.12 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2963  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.37 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000472349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2989  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.69 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.2519e-18  normal  0.394533 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0647  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.14 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  32.12 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1206  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.11 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00151678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2010  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 
144 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0676  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.47 
 
 
137 aa  58.9  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0421  iron-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 
160 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531604  hitchhiker  0.00267682 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1940  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.63 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0534  Rrf2 family protein  45.31 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000152989  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2002  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.78 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.200484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1002  transcriptional regulator, TrmB  45.07 
 
 
151 aa  58.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283031 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  31.39 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  31.39 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2207  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.78 
 
 
160 aa  57.8  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0389  iron-responsive transcriptional regulator  29.2 
 
 
160 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00187363  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1311  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.36 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.582518 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1204  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.71 
 
 
173 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.351528  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1844  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.36 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000462663  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.09 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1648  Iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  31.68 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.223295  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0346  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.05 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000103299  hitchhiker  0.0000140959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.64 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113346  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1277  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.85 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2583  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.79 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.293791  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1265  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.79 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1366  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.79 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>