More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2520 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  93.83 
 
 
162 aa  314  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  80.25 
 
 
162 aa  268  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.4 
 
 
177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0230  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.53 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0200  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.26 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.234084  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.07 
 
 
158 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.59 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.51 
 
 
161 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36381 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.51 
 
 
164 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0154  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.76 
 
 
168 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2054  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.47 
 
 
169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0612  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.52 
 
 
155 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.13 
 
 
159 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9039  putative transcriptional regulator  41.72 
 
 
157 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  40.29 
 
 
169 aa  103  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5746  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.67 
 
 
160 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.4 
 
 
179 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.96 
 
 
162 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  35.58 
 
 
168 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  34.97 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  35.58 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  34.97 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2361  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.48 
 
 
179 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55927  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2120  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.78 
 
 
179 aa  97.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3061  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.88 
 
 
162 aa  97.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.325314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.54 
 
 
180 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2271  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.26 
 
 
179 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448582  normal  0.516915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2876  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.94 
 
 
159 aa  94.7  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.54 
 
 
180 aa  94.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3967  transcriptional regulator  34.19 
 
 
174 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01670  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  38.36 
 
 
156 aa  94.4  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.87 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2937  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.71 
 
 
173 aa  91.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675377  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29300  putative transcriptional regulator  32.9 
 
 
174 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10320  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.93 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4312  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.1 
 
 
191 aa  87.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.784229  normal  0.0976927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.08 
 
 
180 aa  87.4  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.73 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1261  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.36 
 
 
136 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0683  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.55 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000630574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  32.56 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1375  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.61 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1277  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.85 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.81 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.371305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  32.56 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  33.08 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  33.08 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1607  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.29 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.690617  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.48 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0339289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.81 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.11 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1940  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.1 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107659  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1024  RrF2 family protein  28.89 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1366  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.63 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1265  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.63 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1119  RrF2 family protein  30.83 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0514127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2583  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.63 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.293791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.53 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  28.99 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.99 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3442  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.81 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11487  hitchhiker  0.00712317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.5 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.99 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2269  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.97 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1594  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.88 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.202596  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0538  hypothetical protein  36.11 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209147  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.39 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.5 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1300  hypothetical protein  31.39 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0830  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.26 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.6836  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0485  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.93 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0373904  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  29.3 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0779  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.29 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.133557  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01980  Rrf2 family protein  38.02 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2672  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.68 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2078  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.05 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011336  hitchhiker  0.00000000000000153974 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  42 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1268  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.84 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000462831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5300  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.43 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.74 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1002  transcriptional regulator, TrmB  34.81 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283031 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2585  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.78 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.867635 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.74 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0676  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.71 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0499  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.1941  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0730  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.56 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0655  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0512003  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1906  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.5 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000482606  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4173  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.37 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1295  rrf2 family protein  30 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.71 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2519  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.43 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  31.65 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  31.65 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2591  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  31.65 
 
 
162 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>