More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2876 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2876  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
159 aa  322  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  58.27 
 
 
162 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  57.14 
 
 
159 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01670  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  52.32 
 
 
156 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.37 
 
 
177 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  47.97 
 
 
169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  49.65 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0200  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50.7 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.234084  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2054  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.7 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0230  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.89 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.1 
 
 
164 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.1 
 
 
161 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5746  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.25 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1261  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.38 
 
 
169 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0612  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.61 
 
 
155 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0154  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.25 
 
 
168 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9039  putative transcriptional regulator  39.87 
 
 
157 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.72 
 
 
162 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.94 
 
 
162 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.31 
 
 
162 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2120  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.41 
 
 
179 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.94 
 
 
180 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2361  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.57 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55927  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2271  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.13 
 
 
179 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448582  normal  0.516915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.6 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  32.14 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  32.14 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3061  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.18 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.325314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3967  transcriptional regulator  39.42 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  31.55 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  31.55 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29300  putative transcriptional regulator  38.69 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.3 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.91 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.21 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000242173  normal  0.835381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.75 
 
 
180 aa  73.9  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.43 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.67 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4312  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.75 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.784229  normal  0.0976927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.5 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  35.37 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0421  iron-responsive transcriptional regulator  32.19 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531604  hitchhiker  0.00267682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.48 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1295  rrf2 family protein  31.47 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0389  iron-responsive transcriptional regulator  32.19 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00187363  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1607  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.45 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.690617  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.31 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0339289 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10320  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.25 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2937  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.75 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675377  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  29.66 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1445  iron-responsive transcriptional regulator  30.34 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  29.66 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.79 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  29.86 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  29.86 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  29.86 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1232  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.07 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.618772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  29.86 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.17 
 
 
133 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4419  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.22 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1931  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.62 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501375  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3930  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.29 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0485  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.52 
 
 
145 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0373904  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3915  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.29 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3989  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.29 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  43.18 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01980  Rrf2 family protein  39.22 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1639  Rrf2 family protein  30.56 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0683  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.69 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000630574  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1002  transcriptional regulator, TrmB  39 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1300  hypothetical protein  27.86 
 
 
186 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.53 
 
 
156 aa  57.8  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0730  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.05 
 
 
153 aa  57.4  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.58 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.04 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.371305  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11313  hypothetical protein  33.99 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0194  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.48 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2276  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.23 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.802156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0779  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.86 
 
 
132 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.133557  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4174  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.27 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2009  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.46 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.7 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3442  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.5 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11487  hitchhiker  0.00712317 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0538  hypothetical protein  39.71 
 
 
136 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209147  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1206  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.77 
 
 
139 aa  54.3  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00151678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0788  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  23.13 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  28.57 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0655  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.64 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0512003  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3300  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.03 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00214095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  28.57 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0224  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.57 
 
 
199 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.57 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2164  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.23 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000101301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2178  hypothetical protein  45.16 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0936  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.62 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>