More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0788 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0788  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  43.41 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  41.67 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  40.91 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  40.91 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.15 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.15 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  40.15 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.209804  normal  0.479131 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2769  transcriptional repressor NsrR  38.64 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  42.34 
 
 		 150 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 		 141 aa  104  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.48 
 
 		 166 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  37.12 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0047  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 151 aa  104  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000883142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0041  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 151 aa  103  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0191012  hitchhiker  0.000277794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.370774  hitchhiker  0.00270297 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2506  Rrf2 family protein  42.31 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0045  Rrf2 family protein  38.62 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0043  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.93 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000767573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0043  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465453  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.312159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  38.64 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  38.64 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  38.64 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  38.64 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  41.04 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  38.64 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0056  Rrf2 family protein  38.19 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0941015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  38.64 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0226  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3702  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 171 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4764  transcriptional repressor NsrR  37.88 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  37.88 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  38.64 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  0.0000000282304 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  41.61 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.5 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0036  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  40.46 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  37.84 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002267  nitrite-sensitive transcriptional repressor NsrR  40.15 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 		 171 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4221  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00086  transcriptional repressor NsrR  40.91 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.59 
 
 		 163 aa  97.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4474  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000199058  hitchhiker  0.00000000296889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4881  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3220  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 150 aa  95.9  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  37.12 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 172 aa  95.9  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 172 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  37.12 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.6 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1523  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  37.12 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.97 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.85 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.13 
 
 		 160 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.81 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.13 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0518  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0438222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  38.17 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  37.12 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.06 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0640  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.04 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2918  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.996999  normal  0.248939 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  35.14 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.31 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1445  iron-responsive transcriptional regulator  35.61 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>