More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0818 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
126 aa  260  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  68.8 
 
 
133 aa  176  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  68.25 
 
 
133 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  67.46 
 
 
133 aa  174  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  67.46 
 
 
133 aa  174  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  68 
 
 
133 aa  173  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  40.85 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  40.85 
 
 
168 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  40.85 
 
 
168 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  40.85 
 
 
168 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0683  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.44 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000630574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.71 
 
 
180 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3967  transcriptional regulator  37.86 
 
 
174 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29300  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 
174 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.62 
 
 
180 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.56 
 
 
179 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10320  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.88 
 
 
167 aa  91.7  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.3 
 
 
167 aa  91.3  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2120  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.25 
 
 
179 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3061  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.13 
 
 
162 aa  90.5  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.325314  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2937  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.53 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675377  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.76 
 
 
184 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1375  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.08 
 
 
165 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2271  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.81 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448582  normal  0.516915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4312  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.88 
 
 
191 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.784229  normal  0.0976927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2361  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.81 
 
 
179 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55927  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.65 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.55 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.79 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1366  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.3 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1265  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.3 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1277  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.3 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2583  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.3 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.293791  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0779  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.35 
 
 
132 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.133557  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3582  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.9 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000128686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.94 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0538  hypothetical protein  36.27 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209147  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0423  transcriptional regulator  31.09 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0961866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.16 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0200  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.31 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.234084  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3383  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.33 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.3 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3908  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.96 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000530903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2054  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.78 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  27.14 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2259  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.6 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0889  transcriptional regulator  31.54 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00042649  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1452  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.69 
 
 
273 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0426602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0360  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.35 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000032246  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.85 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2009  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.71 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.53 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  35.92 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  31.3 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  0.0000000282304 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.85 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36381 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.36 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.371305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.65 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000242173  normal  0.835381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0830  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.27 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.6836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0341  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.37 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0800800000000001e-33 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  30.3 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  30.3 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1607  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.79 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.690617  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  30.3 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2184  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.92 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0902  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.89 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.15 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  30.3 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3220  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.1 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1940  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.07 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0485  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.46 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0373904  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  29.55 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  30.23 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.53 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.81 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0339289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0230  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.66 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2097  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.29 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1933  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.87 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00888361  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  29.46 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1639  Rrf2 family protein  28.46 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0154  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.43 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2412  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.01 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.141233  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.57 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0993  Rrf2 family protein  36.96 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0992  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.37 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.263725  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2876  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.79 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2428  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.5 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0676  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.09 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3300  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.35 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00214095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1552  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.43 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0323916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3985  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.17 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3804  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.91 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602111  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  28.68 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1449  Rrf2 family protein  36.73 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.302493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2269  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.61 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.396525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>