More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3383 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3383  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  316  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3220  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  80.67 
 
 		 150 aa  260  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0640  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.17 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  40.62 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0043  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465453  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  40.62 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  40.62 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.312159  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0043  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.6 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000767573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4764  transcriptional repressor NsrR  40 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  40.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  40.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  40.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  40.62 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4221  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3203  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.24 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  40 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.96 
 
 		 183 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0041  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0191012  hitchhiker  0.000277794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  40.62 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.62 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  39.84 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  40.62 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  40.62 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0047  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000883142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.370774  hitchhiker  0.00270297 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  40.3 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  38.41 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.339527  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0045  Rrf2 family protein  38.81 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  40.3 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  40.3 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0036  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  40.6 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0915  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  38.06 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  42.42 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  36.72 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  42.19 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  39.84 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3804  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.06 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 150 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.209804  normal  0.479131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  39.84 
 
 		 141 aa  107  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  39.55 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  39.55 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  36.15 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4474  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000199058  hitchhiker  0.00000000296889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3513  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3702  hypothetical protein  37.98 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3453  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.879628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  36.15 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.04 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.55 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.55 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.69 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  38.93 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3450  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2272  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257031  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  38.28 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  0.0000000282304 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0056  Rrf2 family protein  39.1 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0941015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 163 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 172 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00965194  normal  0.580811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  39.84 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550713 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  36.17 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  34.62 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4881  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  38.28 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3032  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3365  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40 
 
 		 188 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4279  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0518  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0438222 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2769  transcriptional repressor NsrR  37.32 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.42 
 
 		 163 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00086  transcriptional repressor NsrR  38.03 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  41.54 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002267  nitrite-sensitive transcriptional repressor NsrR  38.03 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.96 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.334315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>