More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2223 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.339527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  47.89 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  52.71 
 
 
160 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1973  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.26 
 
 
150 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  51.59 
 
 
140 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.04 
 
 
146 aa  120  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  51.94 
 
 
157 aa  120  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  51.94 
 
 
157 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.36 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 
163 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.93 
 
 
154 aa  116  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0640  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.07 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.29 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.55 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1327  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.93 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679067  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0518  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.26 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0438222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.14 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  41.04 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  41.04 
 
 
165 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  41.04 
 
 
162 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  41.33 
 
 
153 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  41.04 
 
 
162 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 
162 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 
162 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  41.04 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  42.55 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.55 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.35 
 
 
165 aa  110  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2918  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.78 
 
 
159 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.996999  normal  0.248939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.94 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.76 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  40.46 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.46 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  40.46 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  40.46 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  40.46 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.79 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4474  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.85 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000199058  hitchhiker  0.00000000296889 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  40.46 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.46 
 
 
141 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  40.46 
 
 
141 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  40.46 
 
 
141 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3383  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.28 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4279  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.11 
 
 
153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.04 
 
 
161 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  41.35 
 
 
142 aa  107  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.79 
 
 
166 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  37.68 
 
 
141 aa  107  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4221  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.71 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.84 
 
 
150 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3220  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.28 
 
 
150 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0226  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.05 
 
 
162 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  39.58 
 
 
150 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  39.69 
 
 
141 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45 
 
 
171 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45 
 
 
171 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45 
 
 
172 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45 
 
 
171 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4881  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.67 
 
 
152 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00086  transcriptional repressor NsrR  41.98 
 
 
141 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  39.39 
 
 
141 aa  103  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.29 
 
 
166 aa  103  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.85 
 
 
146 aa  103  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  36.64 
 
 
141 aa  102  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.52 
 
 
171 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.3 
 
 
149 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.29 
 
 
166 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  37.4 
 
 
141 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2865  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.35 
 
 
157 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.253756  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  37.4 
 
 
141 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  37.4 
 
 
141 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.39 
 
 
156 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.6 
 
 
142 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  35.51 
 
 
141 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  0.0000000282304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  38.17 
 
 
141 aa  101  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36 
 
 
150 aa  100  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.209804  normal  0.479131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  36.64 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  35.53 
 
 
172 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  39.69 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.33 
 
 
159 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4764  transcriptional repressor NsrR  36.64 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1883  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.69 
 
 
169 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00237919  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0536  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.03 
 
 
143 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.315603  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  36.64 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0043  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.12 
 
 
151 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465453  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.53 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0043  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.12 
 
 
151 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000767573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0036  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.12 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.12 
 
 
151 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.312159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  36.57 
 
 
151 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.33 
 
 
159 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.12 
 
 
151 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.86 
 
 
145 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.87 
 
 
167 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.74 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.25 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00085  YhdE (NsrR)  38.35 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>