More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3203 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3203  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
143 aa  277  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  73.94 
 
 
155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3450  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  64.93 
 
 
146 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3513  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  61.97 
 
 
142 aa  173  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22810  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  63.7 
 
 
149 aa  165  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.489543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2020  protein of unknown function UPF0074  49.67 
 
 
177 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.14 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3453  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.08 
 
 
148 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.879628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0915  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.63 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.63 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0358  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  60.36 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0669  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.23 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.416555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00965194  normal  0.580811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3032  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.25 
 
 
143 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3220  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.62 
 
 
150 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3804  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.37 
 
 
141 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602111  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03520  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  48.15 
 
 
157 aa  111  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3383  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.24 
 
 
155 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2272  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.22 
 
 
154 aa  103  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257031  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.69 
 
 
161 aa  100  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.86 
 
 
183 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002267  nitrite-sensitive transcriptional repressor NsrR  39.16 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0640  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.62 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  34.85 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.34 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.34 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  36.88 
 
 
175 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.19 
 
 
161 aa  93.6  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.88 
 
 
166 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00086  transcriptional repressor NsrR  37.06 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.26 
 
 
172 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.96 
 
 
172 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.13 
 
 
171 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0536  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.42 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.315603  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1660  transcriptional regulator  39.1 
 
 
150 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278304 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.23 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  39.23 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  39.23 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  39.23 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  39.23 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3365  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.4 
 
 
188 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312723  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  38.46 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.96 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.96 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2263  putative transcriptional regulator  39.31 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.845273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1378  Rrf2 family protein  39.31 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2390  transcriptional regulator  39.31 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.96 
 
 
171 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2225  Rrf2 family protein  39.31 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.543242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1140  putative transcriptional regulator  39.31 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.155582  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0028  Rrf2 family protein  39.31 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1868  Rrf2 family protein  39.31 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  35.38 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.21 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2204  Rrf2 family protein  37.93 
 
 
180 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0131831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  37.14 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.46 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  38.46 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1327  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.35 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679067  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  37.04 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  32.35 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  37.31 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.76 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  38.46 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.56 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  38.46 
 
 
141 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  30.66 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.56 
 
 
159 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3024  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.44 
 
 
145 aa  84.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  34.62 
 
 
154 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  36.92 
 
 
141 aa  83.6  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  36.92 
 
 
141 aa  83.6  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  36.92 
 
 
141 aa  83.6  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  34.62 
 
 
154 aa  84  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.31 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4764  transcriptional repressor NsrR  36.15 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  36.15 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.51 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  34.51 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.81 
 
 
159 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  36.3 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  36.3 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.06 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.85 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.69 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2769  transcriptional repressor NsrR  32.39 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4221  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.09 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  30.88 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  34.56 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4474  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000199058  hitchhiker  0.00000000296889 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.35 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  35.46 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.64 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2918  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.29 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.996999  normal  0.248939 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.57 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.339527  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.81 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.81 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.72 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.312159  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0043  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.72 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465453  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.72 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>