More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2097 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2097  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  290  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2814  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  69.17 
 
 		 154 aa  201  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1440  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  68.42 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0730  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.62 
 
 		 156 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1023  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1529  hypothetical protein  42.31 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.29 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1748  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.5 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  35.71 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  34.69 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3024  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  36.9 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  36.9 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  33.33 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  33.33 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  33.33 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3795  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0204698  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  33.73 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  33.33 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  30.71 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.58 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  30.83 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.28 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000346494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  32.28 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  32.28 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  32.28 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  32.28 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  31.2 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1327  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679067  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3654  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.02154e-20 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  31.2 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  30.83 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  32.28 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  31.5 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  31.5 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  31.5 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.28 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1660  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  32.28 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  30.83 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1002  transcriptional regulator, TrmB  30.95 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4881  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0536  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.315603  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  31.62 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  31.62 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1543  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.68 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173522  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  34.52 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550713 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.209804  normal  0.479131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0788  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01980  Rrf2 family protein  27.48 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491455  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0936  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.28 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3582  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.68 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000128686  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  33.73 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1648  Iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  34.83 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.223295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  34.88 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  0.0000000282304 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1843  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  30.71 
 
 		 162 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  29.6 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4764  transcriptional repressor NsrR  30.71 
 
 		 162 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  36.14 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0423  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0961866  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.58 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  31.5 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.63 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1241  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.94 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0019006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  29.6 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0730  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1523  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 166 aa  50.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2009  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.09 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1445  iron-responsive transcriptional regulator  31.31 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1933  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.13 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00888361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  34.88 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5033  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.58 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0485  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0373904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  34.88 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>