More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5746 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5746  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  72.08 
 
 
169 aa  224  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9039  putative transcriptional regulator  74.19 
 
 
157 aa  221  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0612  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  67.74 
 
 
155 aa  212  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.55 
 
 
158 aa  134  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.75 
 
 
159 aa  127  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.15 
 
 
177 aa  121  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.11 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01670  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  45.26 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2876  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.25 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.91 
 
 
162 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  40.14 
 
 
169 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.67 
 
 
162 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2054  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.57 
 
 
169 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.67 
 
 
162 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.69 
 
 
161 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36381 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.69 
 
 
164 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0230  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.88 
 
 
166 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1261  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.73 
 
 
136 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0200  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.15 
 
 
166 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.234084  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3967  transcriptional regulator  41.38 
 
 
174 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29300  putative transcriptional regulator  40.69 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0154  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.86 
 
 
168 aa  94  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.5 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2120  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.48 
 
 
179 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.17 
 
 
180 aa  84  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2937  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.58 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675377  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2361  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.58 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55927  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.5 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.24 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2271  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.67 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448582  normal  0.516915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.06 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.86 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0339289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4312  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.49 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.784229  normal  0.0976927 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.67 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.39 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2164  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.58 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000101301  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10320  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.93 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1931  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.56 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501375  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  29.53 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  28.86 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  34.78 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  28.19 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  28.19 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  33.7 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1639  Rrf2 family protein  31.58 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  33.7 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  33.7 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.7 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3061  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.95 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.325314  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1002  transcriptional regulator, TrmB  35.54 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283031 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1241  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.06 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0019006  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0730  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.4 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1375  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.91 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1268  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.78 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000462831  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0788  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3015  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.7 
 
 
136 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1232  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.09 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.618772  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.34 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  33.6 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.37 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113346  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0540  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.83 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.99 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1906  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.16 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000482606  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.99 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2506  Rrf2 family protein  31.65 
 
 
150 aa  61.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2078  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.88 
 
 
148 aa  60.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011336  hitchhiker  0.00000000000000153974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0056  Rrf2 family protein  33.59 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0941015  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1607  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.49 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.690617  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.55 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  28.26 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1028  putative RrF2 family protein  29.63 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0963  RrF2 family protein, putative  29.63 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0041  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.7 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0191012  hitchhiker  0.000277794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3546  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.71 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00044677  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0891  RrF2 family protein, putative  29.63 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1598  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.85 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000262092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.78 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000242173  normal  0.835381 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.5 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.95 
 
 
137 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0047  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.7 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000883142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0043  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.7 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465453  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0043  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.7 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000767573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0191  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.57 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.7 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.370774  hitchhiker  0.00270297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.35 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.7 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.7 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.312159  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0194  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.05 
 
 
146 aa  58.2  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2519  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.67 
 
 
158 aa  58.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0036  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.7 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.37 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4515  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.22 
 
 
179 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.103667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2059  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.22 
 
 
200 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  32.74 
 
 
154 aa  57.4  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0045  Rrf2 family protein  28.95 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1300  hypothetical protein  30.5 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3308  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.93 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0515375  normal  0.0430175 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0942  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.87 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.096782  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1024  RrF2 family protein  30.37 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>