More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0930 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
150 aa  308  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.28 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.27 
 
 
163 aa  126  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  44.03 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  44.03 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  44.03 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  44.03 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  44.03 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  43.28 
 
 
162 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  43.28 
 
 
162 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  43.28 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.78 
 
 
156 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2506  Rrf2 family protein  44.44 
 
 
150 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.26 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.55 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  43.97 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  43.97 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  43.97 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.18 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  42.55 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  42.55 
 
 
141 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.79 
 
 
145 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  44.03 
 
 
147 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.06 
 
 
171 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  43.26 
 
 
162 aa  115  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  44.78 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  0.0000000282304 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  41.73 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.06 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4764  transcriptional repressor NsrR  43.26 
 
 
162 aa  115  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.06 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.84 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  42.55 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  41.84 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  43.26 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  41.84 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.76 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  41.84 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  41.84 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  42.55 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.06 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  41.84 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.38 
 
 
171 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.43 
 
 
146 aa  114  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  41.04 
 
 
144 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1883  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.67 
 
 
169 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00237919  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  41.5 
 
 
175 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.04 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.31 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.26 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.22 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.31 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4279  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.45 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.42 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2769  transcriptional repressor NsrR  43.28 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.55 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  40.43 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  39.1 
 
 
153 aa  110  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.96 
 
 
145 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.28 
 
 
166 aa  110  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1327  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.22 
 
 
168 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679067  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  42.54 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1843  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
139 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  39.72 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.88 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  39.72 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.61 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  38.06 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.81 
 
 
145 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.81 
 
 
145 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  38.81 
 
 
172 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.58 
 
 
166 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.3 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.31 
 
 
150 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.209804  normal  0.479131 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  37.31 
 
 
143 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002267  nitrite-sensitive transcriptional repressor NsrR  43.51 
 
 
141 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  42.54 
 
 
142 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.74 
 
 
156 aa  104  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.81 
 
 
151 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.370774  hitchhiker  0.00270297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0536  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.3 
 
 
143 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.315603  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0041  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.81 
 
 
151 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0191012  hitchhiker  0.000277794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0047  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.81 
 
 
151 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000883142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  41.13 
 
 
141 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2918  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.55 
 
 
159 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.996999  normal  0.248939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.54 
 
 
142 aa  103  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.52 
 
 
143 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0045  Rrf2 family protein  38.06 
 
 
151 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.55 
 
 
147 aa  103  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0226  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.52 
 
 
162 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.55 
 
 
160 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.06 
 
 
151 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.312159  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0043  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.06 
 
 
151 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465453  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2888  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.55 
 
 
144 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1534  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.55 
 
 
144 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353948  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.06 
 
 
151 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1131  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.55 
 
 
144 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  38.52 
 
 
151 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.53 
 
 
175 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0043  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.06 
 
 
151 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000767573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4221  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.46 
 
 
149 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0056  Rrf2 family protein  39.55 
 
 
151 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0941015  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>