More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2918 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2918  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  324  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.996999  normal  0.248939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.96 
 
 
145 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.74 
 
 
152 aa  149  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 
154 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.63 
 
 
165 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  52.94 
 
 
164 aa  147  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  52.94 
 
 
165 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  52.94 
 
 
162 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  52.94 
 
 
162 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  52.94 
 
 
162 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  52.94 
 
 
162 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.52 
 
 
150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  52.21 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  52.21 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.96 
 
 
156 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0226  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.9 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1327  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.94 
 
 
168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679067  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  55.64 
 
 
156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  50.68 
 
 
150 aa  143  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  56.92 
 
 
160 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4279  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.72 
 
 
153 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  52.63 
 
 
142 aa  141  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  50.36 
 
 
153 aa  141  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  56.92 
 
 
157 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  56.92 
 
 
157 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  51.06 
 
 
151 aa  140  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.63 
 
 
142 aa  140  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.89 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.66 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  51.72 
 
 
146 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0518  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.72 
 
 
146 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0438222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  49.65 
 
 
147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.77 
 
 
147 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.45 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.45 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  45.38 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  48.3 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.65 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1973  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.64 
 
 
150 aa  130  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.72 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.9 
 
 
172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  43.37 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.95 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.36 
 
 
175 aa  128  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.72 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.76 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1378  Rrf2 family protein  47.59 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2390  transcriptional regulator  47.59 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1140  putative transcriptional regulator  47.59 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.155582  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2263  putative transcriptional regulator  47.59 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.845273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1868  Rrf2 family protein  47.59 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0028  Rrf2 family protein  47.59 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2225  Rrf2 family protein  47.59 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.543242  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.21 
 
 
172 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.33 
 
 
166 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.21 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.21 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.21 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.67 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.1 
 
 
163 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1523  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.11 
 
 
181 aa  124  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2204  Rrf2 family protein  46.21 
 
 
180 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0131831  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.53 
 
 
161 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  45.26 
 
 
144 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.26 
 
 
145 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.26 
 
 
145 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.41 
 
 
150 aa  120  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2865  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  57.69 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.253756  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4172  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.69 
 
 
182 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2689  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.66 
 
 
145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2135  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  54.17 
 
 
153 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.24 
 
 
140 aa  117  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  42.36 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  41.61 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  42.36 
 
 
153 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2506  Rrf2 family protein  48.87 
 
 
150 aa  114  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0536  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.14 
 
 
143 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.315603  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  45.38 
 
 
143 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  38.13 
 
 
151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  40.71 
 
 
143 aa  113  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.03 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.71 
 
 
143 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  40.97 
 
 
153 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.27 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.370774  hitchhiker  0.00270297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0041  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.27 
 
 
151 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0191012  hitchhiker  0.000277794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0047  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.27 
 
 
151 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000883142 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  38.62 
 
 
156 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.78 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.339527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.43 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.312159  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  40.97 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0043  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.43 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465453  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0043  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.43 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000767573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  37.86 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.43 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4474  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.3 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000199058  hitchhiker  0.00000000296889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0056  Rrf2 family protein  39.72 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0941015  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0045  Rrf2 family protein  39.72 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  37.14 
 
 
154 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  37.14 
 
 
154 aa  107  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0036  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.6 
 
 
151 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>