More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3286 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  289  9e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  93.66 
 
 		 142 aa  273  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4279  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  64.34 
 
 		 153 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  53.96 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4172  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2918  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.996999  normal  0.248939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  50.75 
 
 		 172 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  49.23 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50.36 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  136  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  55.38 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.89 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  55.38 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.89 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  50 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  50 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  50 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.28 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  49.3 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  49.3 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  49.3 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0518  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0438222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  52.76 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1973  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  49.62 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  48.87 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0226  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  47.62 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.86 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  47.33 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  48.09 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  48.09 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  48.09 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  48.09 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  48.09 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.09 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  48.85 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  48.85 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  48.09 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  48.85 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  48.85 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1327  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 168 aa  121  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679067  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  45.8 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  47.33 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  43.14 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  47.33 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4764  transcriptional repressor NsrR  47.33 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 147 aa  120  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  46.56 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1523  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 		 181 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  45.8 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  45.8 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  0.0000000282304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  45.04 
 
 		 141 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.91 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  45.04 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.7 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  44.27 
 
 		 154 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  44.27 
 
 		 154 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0536  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.315603  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2135  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  55.38 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0028  Rrf2 family protein  44.36 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62183  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1378  Rrf2 family protein  44.36 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2390  transcriptional regulator  44.36 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2263  putative transcriptional regulator  44.36 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.845273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1140  putative transcriptional regulator  44.36 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.155582  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2225  Rrf2 family protein  44.36 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.543242  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1868  Rrf2 family protein  44.36 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2204  Rrf2 family protein  44.36 
 
 		 180 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0131831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  38.85 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.48 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  45.8 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  39.13 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2689  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>