More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6231 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  347  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  347  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  98.83 
 
 		 171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  91.46 
 
 		 172 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  90.24 
 
 		 172 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  86.39 
 
 		 171 aa  291  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  87.66 
 
 		 161 aa  269  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  68.45 
 
 		 166 aa  234  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2263  putative transcriptional regulator  75.78 
 
 		 165 aa  233  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.845273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1378  Rrf2 family protein  75.78 
 
 		 165 aa  233  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1140  putative transcriptional regulator  75.78 
 
 		 165 aa  233  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.155582  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2390  transcriptional regulator  75.78 
 
 		 165 aa  233  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2225  Rrf2 family protein  75.78 
 
 		 165 aa  233  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.543242  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1868  Rrf2 family protein  75.78 
 
 		 165 aa  233  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0028  Rrf2 family protein  75.78 
 
 		 165 aa  233  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2204  Rrf2 family protein  76.1 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0131831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  71.97 
 
 		 166 aa  230  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  73.03 
 
 		 175 aa  226  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  52.78 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 150 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50.32 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  49.68 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1523  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  45.64 
 
 		 147 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 146 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0226  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  52.21 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  49.68 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1327  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679067  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  47.3 
 
 		 150 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  48.63 
 
 		 153 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50.68 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.62 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3024  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  41.1 
 
 		 143 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2135  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  53.33 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  44.83 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.09 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  40.41 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.32 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.51 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  44.3 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.45 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2918  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.996999  normal  0.248939 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  43.45 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  43.45 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.27 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  43.45 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  43.45 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  43.45 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.45 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  43.45 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  47.37 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2689  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00086  transcriptional repressor NsrR  48.32 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002267  nitrite-sensitive transcriptional repressor NsrR  47.65 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  43.06 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  42.07 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 147 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 147 aa  121  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  43.06 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  42.07 
 
 		 141 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  43.06 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  42.07 
 
 		 141 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  42.07 
 
 		 141 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  43.06 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  42.07 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  42.65 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0518  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0438222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1973  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  41.38 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  41.38 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  41.38 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4764  transcriptional repressor NsrR  41.38 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  42.07 
 
 		 141 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4221  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  41.38 
 
 		 141 aa  117  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  0.0000000282304 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2506  Rrf2 family protein  46.76 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.06 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.76 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4881  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  39.04 
 
 		 151 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>