More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1598 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1598  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
149 aa  307  4e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000262092  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1748  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.93 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  30.66 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  30.66 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  30.95 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  30.66 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.39 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.68 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0219381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2009  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.6 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0993  Rrf2 family protein  30.84 
 
 
153 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1265  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.61 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.4 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1366  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.61 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1591  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.98 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0612  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.1 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2583  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.61 
 
 
159 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.293791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5746  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.85 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.32 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1730  transcriptional regulator  24.64 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.00066e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0360  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.21 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000032246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  29.58 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1261  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.81 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453217  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0397  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.46 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  29.58 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0341  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.35 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0800800000000001e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1268  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.72 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000462831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3383  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.01 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  27.06 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1931  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.62 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501375  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0730  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.1 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3240  Rrf2 family protein  32.29 
 
 
175 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000396914  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2841  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.63 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000215592  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0485  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.16 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0373904  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1940  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.03 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107659  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3141  Rrf2 family protein  25.6 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.200372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.73 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  28.87 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10320  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.41 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0538  hypothetical protein  25.36 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209147  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  28.87 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.13 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1277  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.59 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.81 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2739  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.6 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.17095  hitchhiker  0.0000000146105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.45 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1594  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.4 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.202596  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1241  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.79 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0019006  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.56 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.41 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2412  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.13 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.141233  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9039  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2506  Rrf2 family protein  26.61 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.63 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0009  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.63 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0683  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.19 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000630574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  21.5 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.15 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.371305  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.21 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2164  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  23.66 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1168  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  23.66 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000039809  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  23.33 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3015  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.74 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1906  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.36 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000482606  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0830  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.47 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.6836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1023  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.38 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3908  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.73 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000530903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1826  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.58 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.63 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2547  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.21 
 
 
264 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0963  RrF2 family protein, putative  30.4 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0891  RrF2 family protein, putative  30.4 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1028  putative RrF2 family protein  30.4 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.56 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.55 
 
 
180 aa  52.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2912  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.9 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0304  rrf2/aminotransferase, class V family protein  29.1 
 
 
530 aa  52.8  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0719  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.27 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000523514  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1933  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.91 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00888361  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.92 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  24.37 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0829  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.21 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1266  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1494  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.42 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00466445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0120  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.83 
 
 
198 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000213431  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1529  hypothetical protein  39.66 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582801  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2060  iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  21.77 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0325541  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.36 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  24.6 
 
 
175 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.58 
 
 
151 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.3 
 
 
159 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1843  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.1 
 
 
139 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1523  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.57 
 
 
181 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2963  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000472349  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2012  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.42 
 
 
147 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0939301  normal  0.0319849 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.47 
 
 
163 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4221  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.61 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.37 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0731  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.04 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>