188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2002 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2002  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  300  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.200484  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.72 
 
 
150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.06 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.48 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.29 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0200  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.78 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.234084  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2054  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.57 
 
 
169 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0230  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.79 
 
 
166 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  25.18 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.78 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36381 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.78 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1774  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.82 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0683  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.58 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000630574  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0154  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.14 
 
 
168 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0788  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.16 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0921  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.05 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.343392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  23.74 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.33 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3308  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0515375  normal  0.0430175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29300  putative transcriptional regulator  35.63 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3240  Rrf2 family protein  31.82 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000396914  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2841  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.82 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000215592  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1277  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.91 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.9 
 
 
162 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  24.82 
 
 
144 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  23.75 
 
 
177 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.76 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.34 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4419  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.23 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3967  transcriptional regulator  34.48 
 
 
174 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  31.4 
 
 
133 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  24.82 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  31.4 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  24.82 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1300  hypothetical protein  30.69 
 
 
186 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  30.59 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  30.59 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2760  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.56 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.54 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.53 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3915  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.23 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3989  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.23 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.29 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.59 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2269  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.72 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3930  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.23 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2276  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.23 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.802156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.59 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.26 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0219381 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  26.24 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0423  transcriptional regulator  28.72 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0961866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1265  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.58 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1529  hypothetical protein  35.71 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582801  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1366  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.58 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  30.34 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  30.34 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.99 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000242173  normal  0.835381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2583  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.58 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.293791  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0935  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.17 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  30.34 
 
 
168 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2739  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.25 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.17095  hitchhiker  0.0000000146105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3141  Rrf2 family protein  31.25 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.200372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  30.34 
 
 
168 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4419  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.58 
 
 
152 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.305649  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10320  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.29 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.55 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0301  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.76 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000799653  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0224  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.21 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.17 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000346494  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.52 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.76 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0485  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.84 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0373904  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3061  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.18 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.325314  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3442  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.74 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11487  hitchhiker  0.00712317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.85 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.57 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.85 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11313  hypothetical protein  27.91 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1364  transcriptional regulator, Rrf2 family  30.43 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000386131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01670  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  25.9 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.71 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  28.08 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0730  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.14 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4604  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.41 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.580547  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3032  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  23.91 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1023  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2876  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.27 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2273  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.77 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.95 
 
 
188 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262259  normal  0.12537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3015  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.91 
 
 
136 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  23.57 
 
 
169 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  28.17 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0676  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.79 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1268  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.91 
 
 
137 aa  43.9  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000462831  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2585  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.07 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.867635 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2010  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  21.11 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  32.14 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  27.4 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  28.57 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1449  Rrf2 family protein  26.67 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.302493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>