61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0618 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0633  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0618  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0243  hypothetical protein  58.99 
 
 
140 aa  166  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.21 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  26.28 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  24.44 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.36 
 
 
143 aa  52  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  23.31 
 
 
138 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  24.64 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.09 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  23.7 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  23.7 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  23.7 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  23.7 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  23.7 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  23.7 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  23.7 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  23.7 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  23.7 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0624  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.74 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  0.570271 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.76 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3431  rrf2 family protein  21.58 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1837  rrf2 family protein  21.58 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.886033  normal  0.370465 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25.93 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  26.67 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1753  putative transcriptional regulator  25.17 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0641  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  20.97 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  23 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3409  rrf2 family protein  20.86 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3421  rrf2 family protein  20.86 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.26 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.4 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.56 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2547  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  22.88 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  21.58 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  25 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.81 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000874227  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  27.63 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  25 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  23.36 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  25.19 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  25 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3108  transcriptional regulator  20.86 
 
 
137 aa  42  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3180  transcriptional regulator  20.86 
 
 
137 aa  42  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0130627  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  25 
 
 
172 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3453  rrf2 family protein  20.86 
 
 
137 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.756851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3200  rrf2 family protein  20.86 
 
 
137 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3419  rrf2 family protein  20.86 
 
 
137 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  21.74 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  22.5 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  22.63 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  21.8 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  25 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  27.43 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  22.03 
 
 
137 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  24.29 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  33.33 
 
 
133 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  33.33 
 
 
133 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  22.9 
 
 
136 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>