144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5149 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4766  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.54 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.26 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  38.41 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1452  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0426602  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.31 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  30.71 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3119  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3335  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  30 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.61 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  30 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  30 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.09 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.82 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  34.09 
 
 		 187 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0788  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  30.28 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  32.62 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  32.62 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  32.62 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  32.62 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  32.62 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.29 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  32.62 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  32.62 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  32.62 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  32.62 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0779  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.23 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.133557  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.91 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.09 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.79 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  35.56 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4175  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.37 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115684  normal  0.217093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2937  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1748  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  28.15 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  25.55 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1206  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00151678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000242173  normal  0.835381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1241  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.46 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0019006  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0641  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  36.71 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1779  rrf2 family protein  31.94 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1758  RRF2 family protein  31.94 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  31.94 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  25.55 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  31.94 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1953  rrf2 family protein  31.94 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000194706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2618  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1270  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.07 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2001  rrf2 family protein  31.25 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  35.44 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2022  rrf2 family protein  31.94 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000169778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  35.44 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3422  rrf2 family protein  31.94 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000049923 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1295  rrf2 family protein  29.59 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1552  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.27 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0323916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1168  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000039809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0540  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1921  rrf2 family protein  31.94 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.581876  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1321  Rrf2 family protein  34.31 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0624  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.85 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  0.570271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.47 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3865  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4175  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.123963  normal  0.162112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  42.35 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  42.35 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.61 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  42.35 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  42.35 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  42.35 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  42.35 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1607  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  23.36 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.690617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2269  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.58 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  29.46 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>