85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4985 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4985  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  277  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0980195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09960  hypothetical protein  48.04 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0924  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4329  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  44.86 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3265  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 173 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1261  transcriptional regulator  43.93 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62551  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3584  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855129  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1000  transcriptional regulator  43.93 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1311  hypothetical protein  43.93 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1334  DNA-binding protein  43.93 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0567  transcriptional regulator  43.93 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0293  transcriptional regulator  43.93 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0135694  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2516  putative DNA-binding protein  43.93 
 
 		 571 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.96 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0368  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172949 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5306  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4530  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.88 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193986  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 146 aa  84.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740376  hitchhiker  0.00818158 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2538  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724795  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4418  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.88 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4048  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2256  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3119  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.18 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2628  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0098  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.78 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1052  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3952  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 146 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274037  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2547  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3335  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6236  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.38 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3567  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1079  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.46 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal  0.359746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.41 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.71 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2648  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.66 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.05 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3614  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.32 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  35.29 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.84 
 
 		 151 aa  50.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.43 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.339527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5019  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0401266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  24.24 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  35.35 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  31.31 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.12 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.91 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1717  Rrf2 family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1684  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000480817  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1753  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 		 140 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0924  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.47 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  29.52 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0920  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.337139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>