147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2386 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2386  flagellar hook-associated 2 domain protein  100 
 
 
686 aa  1365    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1621  flagellar hook-associated protein 2 domain protein  37.15 
 
 
579 aa  238  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2119  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.86 
 
 
575 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1120  flagellar hook-associated protein 2, putative  33.63 
 
 
575 aa  221  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.176879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2912  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.4 
 
 
577 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139401 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0530  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.25 
 
 
1025 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.82 
 
 
462 aa  99  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.58 
 
 
468 aa  79.7  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.27 
 
 
487 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2315  flagellar capping protein  27.54 
 
 
646 aa  73.9  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0764  flagellar filament cap protein FliD  23.54 
 
 
766 aa  70.5  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  30.6 
 
 
469 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.22 
 
 
554 aa  70.5  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28 
 
 
457 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.82 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  28.4 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  28.72 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.05 
 
 
456 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  28.46 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  27 
 
 
487 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.35 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  28.4 
 
 
441 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  27.88 
 
 
438 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  26.96 
 
 
456 aa  65.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.76 
 
 
471 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.33 
 
 
456 aa  63.9  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03169  flagellar capping protein  27.72 
 
 
670 aa  63.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  28.25 
 
 
454 aa  63.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.96 
 
 
447 aa  62.4  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.21 
 
 
456 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.82 
 
 
454 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.82 
 
 
454 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.72 
 
 
504 aa  61.6  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.96 
 
 
457 aa  61.6  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.87 
 
 
473 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  27.51 
 
 
442 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  27.9 
 
 
452 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1724  flagellar capping protein  27.32 
 
 
666 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0724566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3160  putative flagellar hook-associated protein 2 (HAP2, fliD protein)  24.5 
 
 
572 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0737875  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002808  flagellar hook-associated protein FliD  27.23 
 
 
663 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  30.57 
 
 
468 aa  59.3  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2418  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.48 
 
 
612 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  30.57 
 
 
468 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  30.57 
 
 
468 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  30.57 
 
 
468 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.57 
 
 
468 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  30.57 
 
 
465 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0994  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.19 
 
 
434 aa  58.9  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.864471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3568  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.16 
 
 
546 aa  58.9  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.888241  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.34 
 
 
456 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2535  flagellar hook-associated protein 2 (FliD, filament cap protein)  27.07 
 
 
551 aa  58.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  24.77 
 
 
471 aa  58.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0197  flagellar capping protein-like protein  33.33 
 
 
893 aa  57.8  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1783  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.72 
 
 
606 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  29.73 
 
 
490 aa  57.4  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.49 
 
 
451 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0867  flagellar hook-associated 2-like  26.02 
 
 
568 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0148  flagellar hook-associated protein FliD  20.98 
 
 
665 aa  57  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  30.69 
 
 
466 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0400  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.64 
 
 
594 aa  57  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.157699  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  30.69 
 
 
466 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.27 
 
 
438 aa  57  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  29.77 
 
 
452 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  23.97 
 
 
462 aa  56.2  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.25 
 
 
657 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.2 
 
 
479 aa  56.6  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  26.83 
 
 
477 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  26.25 
 
 
458 aa  55.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.92 
 
 
678 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1500  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.7 
 
 
591 aa  55.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  28.93 
 
 
471 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.92 
 
 
678 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  22.76 
 
 
458 aa  55.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  30.16 
 
 
466 aa  55.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  29.75 
 
 
495 aa  54.7  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.11 
 
 
465 aa  54.7  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  27.23 
 
 
665 aa  54.3  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  29.59 
 
 
452 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.02 
 
 
455 aa  53.9  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  26.7 
 
 
441 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  30.73 
 
 
498 aa  53.9  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.62 
 
 
451 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 
457 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  26.7 
 
 
441 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  20.53 
 
 
487 aa  52.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  27.51 
 
 
474 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0312  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.04 
 
 
691 aa  53.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0353  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.99 
 
 
502 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  26.92 
 
 
685 aa  52.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  25.27 
 
 
692 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.12 
 
 
502 aa  52  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.42 
 
 
477 aa  52  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  24.14 
 
 
541 aa  51.6  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  25.65 
 
 
492 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.04 
 
 
504 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3464  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  24.89 
 
 
483 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538459  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.34 
 
 
467 aa  50.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  28.62 
 
 
441 aa  50.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.05 
 
 
476 aa  50.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0761  flagellar hook-associated protein  25.73 
 
 
559 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>