212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3083 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  100 
 
 		 486 aa  962    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.95 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  32.93 
 
 		 471 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.98 
 
 		 457 aa  209  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.62 
 
 		 457 aa  206  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  32.03 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.92 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.47 
 
 		 456 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.15 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.27 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.85 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  30.49 
 
 		 456 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 451 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.6 
 
 		 454 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.94 
 
 		 452 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.6 
 
 		 454 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.77 
 
 		 455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  29.21 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.38 
 
 		 477 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  28.05 
 
 		 477 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  28.75 
 
 		 452 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.5 
 
 		 471 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  28.51 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.24 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.26 
 
 		 468 aa  150  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  29.98 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.8 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3464  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.44 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  30.4 
 
 		 478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  28.34 
 
 		 458 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.61 
 
 		 476 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.87 
 
 		 465 aa  138  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  29.55 
 
 		 677 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3568  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  40 
 
 		 546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.888241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  26.42 
 
 		 484 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.82 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  27.59 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  30.07 
 
 		 668 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.58 
 
 		 463 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  27.88 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  29.37 
 
 		 669 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.96 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.49 
 
 		 657 aa  124  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  27.12 
 
 		 474 aa  123  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  26.81 
 
 		 469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  27.99 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  26.2 
 
 		 445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.79 
 
 		 468 aa  120  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  27.79 
 
 		 468 aa  120  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.39 
 
 		 473 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  27.79 
 
 		 468 aa  120  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  27.79 
 
 		 468 aa  120  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.04 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 475 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 458 aa  117  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  27.68 
 
 		 541 aa  116  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.35 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.87 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.62 
 
 		 680 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  27.68 
 
 		 541 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.62 
 
 		 680 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.57 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.51 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.91 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  27.22 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  26.22 
 
 		 498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  25.48 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  24.31 
 
 		 487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.98 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  23.72 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.72 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  26.36 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.16 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  25.2 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.17 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  26.18 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.02 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  26.18 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  27.8 
 
 		 781 aa  107  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  26.84 
 
 		 685 aa  107  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  27.37 
 
 		 505 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  26.5 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  25.91 
 
 		 452 aa  105  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  27.07 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  25.15 
 
 		 487 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  25 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.77 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  28.23 
 
 		 495 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  28.54 
 
 		 474 aa  103  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  25.53 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  25.05 
 
 		 471 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.44 
 
 		 502 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  26 
 
 		 678 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  26 
 
 		 678 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.44 
 
 		 448 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  22.68 
 
 		 487 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27 
 
 		 500 aa  97.8  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>