150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0197 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0197  flagellar capping protein-like protein  100 
 
 		 893 aa  1821    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3015  flagellar capping protein  35.59 
 
 		 528 aa  171  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0464  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.38 
 
 		 519 aa  170  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0442639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2218  flagellar hook-associated 2-like protein  37.9 
 
 		 838 aa  167  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1783  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.91 
 
 		 606 aa  165  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  36.58 
 
 		 500 aa  162  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.85 
 
 		 504 aa  160  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2418  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 612 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4166  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.63 
 
 		 510 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1653  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.56 
 
 		 524 aa  134  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0105  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.5 
 
 		 778 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.28 
 
 		 462 aa  95.9  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1693  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.01 
 
 		 611 aa  94.7  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0312  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 691 aa  87.4  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1623  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.8 
 
 		 607 aa  84  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2229  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.19 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000532748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  29.96 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0353  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.36 
 
 		 502 aa  80.5  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  26.67 
 
 		 632 aa  80.1  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.56 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.41 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  26.67 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  25.86 
 
 		 471 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.4 
 
 		 487 aa  69.7  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.33 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  26.33 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  26.33 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  26.33 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  26.33 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.31 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.16 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.4 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.04 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.35 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  24.46 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.89 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.44 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  24.46 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.54 
 
 		 479 aa  63.9  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.87 
 
 		 465 aa  63.9  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0807  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.73 
 
 		 831 aa  63.9  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.14 
 
 		 451 aa  63.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.67 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  22.22 
 
 		 454 aa  62  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.73 
 
 		 457 aa  62  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.88 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  29.95 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  29.61 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.25 
 
 		 456 aa  60.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  26.82 
 
 		 669 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.85 
 
 		 678 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  25.26 
 
 		 668 aa  59.3  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.5 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.25 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.73 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.85 
 
 		 678 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.88 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2386  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.33 
 
 		 686 aa  58.2  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.73 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  22.36 
 
 		 456 aa  57  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0400  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.2 
 
 		 594 aa  57  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.157699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1120  flagellar hook-associated protein 2, putative  29.55 
 
 		 575 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.176879  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1500  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.3 
 
 		 591 aa  57  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  27.8 
 
 		 677 aa  56.2  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  28.3 
 
 		 442 aa  56.2  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0984  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.5 
 
 		 469 aa  56.2  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  25.47 
 
 		 477 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.5 
 
 		 504 aa  56.2  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  26.59 
 
 		 471 aa  55.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  22.83 
 
 		 454 aa  55.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  25 
 
 		 445 aa  55.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  25.38 
 
 		 467 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  25.38 
 
 		 467 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  24.28 
 
 		 448 aa  53.5  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  25.38 
 
 		 467 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  24.51 
 
 		 441 aa  52.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  24.11 
 
 		 490 aa  52.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.66 
 
 		 454 aa  52.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.5 
 
 		 487 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  22.97 
 
 		 499 aa  52  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1627  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.43 
 
 		 523 aa  52  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.34 
 
 		 448 aa  51.6  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  28.06 
 
 		 506 aa  51.6  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0092  flagellar hook-associated protein  27.78 
 
 		 506 aa  51.6  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.18 
 
 		 479 aa  52  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3449  flagellar hook-associated protein 2  28.06 
 
 		 506 aa  51.6  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0369122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1670  flagellar hook-associated protein 2  28.06 
 
 		 506 aa  51.6  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3871  flagellar hook-associated protein  27.78 
 
 		 506 aa  51.6  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3953  flagellar hook-associated protein  27.78 
 
 		 506 aa  51.6  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3101  flagellar hook-associated protein 2  28.06 
 
 		 506 aa  51.6  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  25.49 
 
 		 541 aa  51.6  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2315  flagellar capping protein  28.29 
 
 		 646 aa  51.6  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  24.82 
 
 		 466 aa  51.2  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  24.82 
 
 		 466 aa  51.2  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3640  flagellar capping protein  28.03 
 
 		 439 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1724  flagellar capping protein  25.98 
 
 		 666 aa  51.2  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0724566  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1693  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.71 
 
 		 933 aa  51.2  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  25.49 
 
 		 541 aa  50.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  30.19 
 
 		 665 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>