224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1284 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  78.85 
 
 		 467 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  100 
 
 		 468 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  78.85 
 
 		 467 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  78.85 
 
 		 467 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  99.79 
 
 		 468 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  53.45 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  52.34 
 
 		 471 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  53.45 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  53.45 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  53.45 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  53.45 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  53.23 
 
 		 468 aa  425  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  48.19 
 
 		 466 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  47.97 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  46.68 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  47.77 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  42.54 
 
 		 474 aa  323  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  40.67 
 
 		 472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  41.36 
 
 		 499 aa  316  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  42.8 
 
 		 479 aa  312  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  37.42 
 
 		 458 aa  270  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  40.36 
 
 		 488 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  38.35 
 
 		 471 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  37.98 
 
 		 490 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  38.62 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  36.89 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  36.94 
 
 		 498 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  36.19 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.71 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  36.64 
 
 		 487 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1580  flagellar hook-associated 2 domain protein  39.71 
 
 		 473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.93 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  33.96 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.67 
 
 		 678 aa  183  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.67 
 
 		 678 aa  183  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  33.41 
 
 		 685 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  32.37 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.37 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.06 
 
 		 680 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.06 
 
 		 680 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.16 
 
 		 502 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.6 
 
 		 500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  31.29 
 
 		 668 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  31.17 
 
 		 458 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.75 
 
 		 487 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.21 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  35.8 
 
 		 677 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  34.8 
 
 		 669 aa  163  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  35.02 
 
 		 665 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.45 
 
 		 505 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.05 
 
 		 502 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.32 
 
 		 455 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  30.08 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.82 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  32.21 
 
 		 472 aa  157  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  29.57 
 
 		 505 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  29.32 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  28.51 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.22 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.48 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.18 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  28.81 
 
 		 504 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.81 
 
 		 504 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.25 
 
 		 462 aa  150  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.08 
 
 		 457 aa  150  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.33 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  28.48 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  30.04 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  30.33 
 
 		 477 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.5 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.58 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  27.1 
 
 		 454 aa  144  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  31.08 
 
 		 474 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 470 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  27.95 
 
 		 513 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.6 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  27.22 
 
 		 507 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.33 
 
 		 657 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  27.22 
 
 		 507 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3197  flagellar hook-associated protein 2  30.58 
 
 		 508 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  30.23 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  27.42 
 
 		 507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  27.42 
 
 		 507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  27.42 
 
 		 507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  27.42 
 
 		 507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3953  flagellar hook-associated protein  29.96 
 
 		 506 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  29.96 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0092  flagellar hook-associated protein  29.96 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3449  flagellar hook-associated protein 2  29.96 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0369122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1670  flagellar hook-associated protein 2  29.96 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3871  flagellar hook-associated protein  29.96 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  27.01 
 
 		 507 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3101  flagellar hook-associated protein 2  29.96 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.24 
 
 		 452 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.09 
 
 		 456 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.36 
 
 		 476 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.73 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>