163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1623 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1693  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  93.56 
 
 
611 aa  1104    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1623  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
607 aa  1229    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1500  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  45.95 
 
 
591 aa  489  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0400  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  41.54 
 
 
594 aa  440  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.157699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0353  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.54 
 
 
502 aa  221  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2218  flagellar hook-associated 2-like protein  30.49 
 
 
838 aa  153  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  27.06 
 
 
632 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2418  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.08 
 
 
612 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  31.86 
 
 
500 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3015  flagellar capping protein  30.21 
 
 
528 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.02 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1783  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.25 
 
 
606 aa  114  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.12 
 
 
504 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0105  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.31 
 
 
778 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.03 
 
 
457 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.93 
 
 
454 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.93 
 
 
454 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.08 
 
 
475 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0444  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.32 
 
 
587 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985336  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0197  flagellar capping protein-like protein  25.05 
 
 
893 aa  96.3  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  27.38 
 
 
454 aa  94.7  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.7 
 
 
456 aa  95.1  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0464  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.76 
 
 
519 aa  94.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0442639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.7 
 
 
457 aa  93.2  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1653  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.14 
 
 
524 aa  92.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4166  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.81 
 
 
510 aa  90.9  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  29.55 
 
 
458 aa  90.9  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  27.43 
 
 
474 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.95 
 
 
457 aa  89.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.27 
 
 
456 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  25.89 
 
 
454 aa  87.4  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.37 
 
 
473 aa  87.4  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  24.49 
 
 
456 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  28.36 
 
 
441 aa  86.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.36 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  30.06 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.07 
 
 
456 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  27.91 
 
 
487 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.25 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0800  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.62 
 
 
500 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.15 
 
 
478 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.56 
 
 
452 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.59 
 
 
499 aa  77.4  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.05 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  27.05 
 
 
469 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.24 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.78 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2229  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.64 
 
 
531 aa  73.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000532748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.57 
 
 
465 aa  73.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.97 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  25.14 
 
 
490 aa  72  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.47 
 
 
448 aa  72  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  24.1 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.05 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  25.7 
 
 
477 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.76 
 
 
447 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  25.46 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  27.46 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.13 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0984  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.33 
 
 
469 aa  68.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.61 
 
 
487 aa  68.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  26.96 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.92 
 
 
472 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0312  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.37 
 
 
691 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.06 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.07 
 
 
477 aa  67.4  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.08 
 
 
449 aa  67  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.05 
 
 
473 aa  67  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1472  flagellar hook-associated protein FliD  26.02 
 
 
652 aa  66.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  23.33 
 
 
468 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.65 
 
 
477 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  23.33 
 
 
468 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  24.62 
 
 
442 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  31.71 
 
 
781 aa  65.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.68 
 
 
473 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.45 
 
 
475 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2315  flagellar capping protein  24.33 
 
 
646 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  23.99 
 
 
484 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  28.03 
 
 
462 aa  62.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  24.78 
 
 
456 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1724  flagellar capping protein  25.19 
 
 
666 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0724566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0733  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.73 
 
 
734 aa  62.4  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  24.12 
 
 
471 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.78 
 
 
482 aa  60.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  23.98 
 
 
466 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03169  flagellar capping protein  22.61 
 
 
670 aa  60.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.58 
 
 
448 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  23.98 
 
 
466 aa  60.8  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1760  flagellar capping protein  21.51 
 
 
469 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.933006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.36 
 
 
448 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  23.58 
 
 
466 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.7 
 
 
475 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002808  flagellar hook-associated protein FliD  23.37 
 
 
663 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3640  flagellar capping protein  26.16 
 
 
439 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.59 
 
 
470 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  23.48 
 
 
504 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.48 
 
 
504 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0807  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.38 
 
 
831 aa  58.2  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31280  flagellar capping protein  24.79 
 
 
460 aa  58.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  24.5 
 
 
471 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>