220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5091 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  100 
 
 
471 aa  927    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  49.29 
 
 
487 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  47.24 
 
 
482 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  47.67 
 
 
490 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  47.83 
 
 
498 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  46.44 
 
 
488 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  41.31 
 
 
458 aa  303  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  41.29 
 
 
465 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  41.03 
 
 
445 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  41.96 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  40.5 
 
 
471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  38.71 
 
 
441 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  41.75 
 
 
466 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  41.75 
 
 
466 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  41.49 
 
 
468 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  41.49 
 
 
468 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  41.49 
 
 
468 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  41.29 
 
 
468 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  41.29 
 
 
468 aa  266  5.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  38.02 
 
 
468 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  38.35 
 
 
468 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  38.1 
 
 
467 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  37.89 
 
 
467 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  37.89 
 
 
467 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  39.74 
 
 
665 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  36.34 
 
 
447 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.37 
 
 
472 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.04 
 
 
479 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  35.81 
 
 
474 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.75 
 
 
465 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  32.15 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  32.31 
 
 
487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  32.77 
 
 
458 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  32.08 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.86 
 
 
479 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.77 
 
 
477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.76 
 
 
499 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.4 
 
 
457 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  35.22 
 
 
668 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.61 
 
 
456 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  30.04 
 
 
541 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  36.64 
 
 
678 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  36.64 
 
 
678 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.37 
 
 
657 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.64 
 
 
456 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.75 
 
 
473 aa  183  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1580  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.51 
 
 
473 aa  183  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.62 
 
 
457 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.4 
 
 
468 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.71 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.71 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  30.04 
 
 
541 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.1 
 
 
680 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.1 
 
 
680 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.57 
 
 
462 aa  179  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  32.17 
 
 
469 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  33.16 
 
 
677 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.56 
 
 
451 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.64 
 
 
487 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.2 
 
 
452 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.08 
 
 
454 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  33.25 
 
 
669 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.31 
 
 
456 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  35.38 
 
 
685 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.91 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.4 
 
 
456 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.93 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  31.82 
 
 
441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.62 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  31.82 
 
 
441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.77 
 
 
457 aa  170  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  29.79 
 
 
452 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  29.98 
 
 
454 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.01 
 
 
473 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  30.49 
 
 
452 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  33.69 
 
 
472 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.61 
 
 
475 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.48 
 
 
502 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  29.41 
 
 
454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.47 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.02 
 
 
451 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.19 
 
 
473 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  31.07 
 
 
502 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.07 
 
 
502 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  30.1 
 
 
477 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.85 
 
 
451 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  28.06 
 
 
495 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.1 
 
 
471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  30.4 
 
 
500 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.63 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.98 
 
 
470 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.08 
 
 
477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.02 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  30.18 
 
 
492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.71 
 
 
478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.73 
 
 
502 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  30.58 
 
 
474 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.18 
 
 
472 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  25.31 
 
 
478 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.43 
 
 
500 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>