211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03169 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03169  flagellar capping protein  100 
 
 		 670 aa  1361    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002808  flagellar hook-associated protein FliD  87.14 
 
 		 663 aa  1168    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1724  flagellar capping protein  65.18 
 
 		 666 aa  867    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0724566  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2315  flagellar capping protein  43.65 
 
 		 646 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.3 
 
 		 453 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.19 
 
 		 451 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  38.95 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.5 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.04 
 
 		 457 aa  124  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.88 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.76 
 
 		 454 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.89 
 
 		 452 aa  117  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  32.11 
 
 		 456 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.79 
 
 		 457 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.08 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 456 aa  110  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 457 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 456 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  30.12 
 
 		 454 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.68 
 
 		 470 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  33.2 
 
 		 458 aa  107  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.57 
 
 		 454 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.51 
 
 		 455 aa  107  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.57 
 
 		 454 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  29.82 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  31.05 
 
 		 454 aa  106  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  31.3 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  31.25 
 
 		 477 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.73 
 
 		 473 aa  99.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  27.54 
 
 		 487 aa  98.6  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.44 
 
 		 468 aa  97.4  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  32.5 
 
 		 665 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  26.81 
 
 		 458 aa  95.9  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  28.77 
 
 		 498 aa  95.5  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  30.21 
 
 		 474 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  28.45 
 
 		 452 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3464  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  32.62 
 
 		 483 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  31.44 
 
 		 441 aa  93.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  31.44 
 
 		 441 aa  93.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.12 
 
 		 475 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  26.07 
 
 		 445 aa  93.2  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  32.8 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  28.33 
 
 		 472 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  27.63 
 
 		 487 aa  92.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.57 
 
 		 482 aa  91.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  33.33 
 
 		 668 aa  91.7  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  28.06 
 
 		 448 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.81 
 
 		 471 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.51 
 
 		 476 aa  89.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  31.55 
 
 		 500 aa  88.2  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  26.69 
 
 		 490 aa  88.6  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  29.61 
 
 		 505 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.65 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  29.13 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0800  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.04 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  27.92 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.69 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.05 
 
 		 479 aa  85.5  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.4 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.44 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.49 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  32.1 
 
 		 677 aa  84.3  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  29.57 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.57 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  29.86 
 
 		 471 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.46 
 
 		 465 aa  83.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.14 
 
 		 475 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  27.34 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.92 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  27.83 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.83 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  25.39 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  30.32 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  28.92 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.39 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  23.83 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.18 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  27.31 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  29.44 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  29.44 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  32.78 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  29.44 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  29.44 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  29.05 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  29.44 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  29.44 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  29.44 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.5 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.49 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  32.22 
 
 		 466 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  30.57 
 
 		 465 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  32.22 
 
 		 466 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.2 
 
 		 448 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  27.94 
 
 		 541 aa  76.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3568  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.37 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.888241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.83 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.42 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  27.78 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.44 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>