215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0504 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
476 aa  935    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  40.04 
 
 
477 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  36.54 
 
 
458 aa  246  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.47 
 
 
452 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  37.03 
 
 
677 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.13 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.61 
 
 
468 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.33 
 
 
454 aa  206  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  32.42 
 
 
441 aa  206  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.39 
 
 
487 aa  203  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.81 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.54 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  30.25 
 
 
458 aa  199  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  30.24 
 
 
454 aa  196  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.89 
 
 
457 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.31 
 
 
455 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.94 
 
 
657 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  29.16 
 
 
454 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.52 
 
 
457 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  30.77 
 
 
478 aa  187  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  26.98 
 
 
490 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.31 
 
 
482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  33.08 
 
 
669 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  29.6 
 
 
477 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.56 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.62 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  29.15 
 
 
488 aa  181  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  31.06 
 
 
665 aa  179  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.42 
 
 
454 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.18 
 
 
462 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.59 
 
 
456 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  27.49 
 
 
456 aa  177  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  27.43 
 
 
452 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  26.36 
 
 
498 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.92 
 
 
456 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  27.18 
 
 
487 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  25.62 
 
 
471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.7 
 
 
456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.1 
 
 
457 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.95 
 
 
472 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  27.67 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  29.79 
 
 
445 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  24.46 
 
 
487 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.67 
 
 
475 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.88 
 
 
473 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  29.11 
 
 
477 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  28.29 
 
 
492 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.78 
 
 
479 aa  156  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  26.28 
 
 
472 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  27.73 
 
 
500 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  28.61 
 
 
668 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  27.63 
 
 
692 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  24.52 
 
 
474 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.03 
 
 
680 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  27.27 
 
 
541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.03 
 
 
680 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  27 
 
 
465 aa  148  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  27.44 
 
 
541 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3464  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.18 
 
 
483 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538459  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.32 
 
 
471 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.16 
 
 
465 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.17 
 
 
487 aa  143  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.26 
 
 
502 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  26.61 
 
 
486 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  25.95 
 
 
502 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.95 
 
 
502 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  24.53 
 
 
452 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.34 
 
 
470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.35 
 
 
504 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.6 
 
 
678 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.6 
 
 
678 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  25.36 
 
 
468 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  26.56 
 
 
504 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.56 
 
 
504 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  25.95 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  25.36 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.95 
 
 
468 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  25.95 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  25.95 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  26.92 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  25.95 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  28.94 
 
 
441 aa  134  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  28.94 
 
 
441 aa  134  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.8 
 
 
500 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  26.76 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.46 
 
 
475 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  25 
 
 
448 aa  130  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  26.29 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  25.26 
 
 
466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  25 
 
 
507 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  25 
 
 
507 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3197  flagellar hook-associated protein 2  26.88 
 
 
508 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  25.26 
 
 
466 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.48 
 
 
473 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  26.56 
 
 
685 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  24.84 
 
 
507 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  25.54 
 
 
781 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.07 
 
 
463 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  24.79 
 
 
507 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  24.84 
 
 
507 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>