226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1317 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  100 
 
 		 454 aa  892    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  64.98 
 
 		 454 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  64.76 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  65.27 
 
 		 456 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  65.93 
 
 		 457 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  63.96 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  63.52 
 
 		 456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  63.66 
 
 		 457 aa  578  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  63.08 
 
 		 457 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  63.08 
 
 		 456 aa  571  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  62.25 
 
 		 456 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  62.25 
 
 		 454 aa  561  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  47.91 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  47.11 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  45.39 
 
 		 455 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  45.49 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 487 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  36.61 
 
 		 478 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.38 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  36.22 
 
 		 677 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  35.99 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.83 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  32.03 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.68 
 
 		 452 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.42 
 
 		 471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  35.28 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  35.28 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.64 
 
 		 473 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  32.47 
 
 		 458 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.03 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  34.19 
 
 		 472 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.57 
 
 		 475 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.16 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 479 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  35.43 
 
 		 669 aa  186  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  31.08 
 
 		 474 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  30.64 
 
 		 492 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3464  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  32.55 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  32.02 
 
 		 477 aa  177  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  31.93 
 
 		 484 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  31.32 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.6 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  30 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  27.25 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  31.94 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.96 
 
 		 500 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  29.23 
 
 		 487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  32.56 
 
 		 668 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.81 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  30.66 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  30.56 
 
 		 495 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  30.53 
 
 		 502 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 502 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  29.98 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.31 
 
 		 502 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.07 
 
 		 472 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.85 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  29.27 
 
 		 541 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  28.99 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  34.2 
 
 		 665 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  29.01 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.92 
 
 		 505 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  29.27 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  30.04 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  29.89 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  26.93 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  28.8 
 
 		 541 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  29.25 
 
 		 488 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  29.76 
 
 		 505 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  29.81 
 
 		 781 aa  150  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  30.4 
 
 		 468 aa  149  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.04 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0092  flagellar hook-associated protein  31.1 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  30.04 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  30.04 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3871  flagellar hook-associated protein  31.1 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  30.04 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  30.3 
 
 		 692 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  28.1 
 
 		 498 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3953  flagellar hook-associated protein  31.1 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  27.89 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  29.3 
 
 		 504 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.3 
 
 		 504 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  30.89 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3197  flagellar hook-associated protein 2  30.67 
 
 		 508 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.92 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3449  flagellar hook-associated protein 2  30.89 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0369122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1670  flagellar hook-associated protein 2  30.89 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3101  flagellar hook-associated protein 2  30.89 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  27.1 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  27.1 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.18 
 
 		 479 aa  144  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.31 
 
 		 472 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.11 
 
 		 477 aa  143  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.14 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.32 
 
 		 657 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  28.63 
 
 		 467 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>