227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1592 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  100 
 
 		 665 aa  1298    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  47.31 
 
 		 669 aa  527  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  44.75 
 
 		 685 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  45.11 
 
 		 680 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  45.11 
 
 		 680 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  42.99 
 
 		 678 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  42.99 
 
 		 678 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  42.94 
 
 		 677 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  41.16 
 
 		 668 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  49.13 
 
 		 482 aa  344  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.18 
 
 		 657 aa  323  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  45.62 
 
 		 490 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  44.83 
 
 		 498 aa  300  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  42.43 
 
 		 488 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  39.19 
 
 		 487 aa  260  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  39.74 
 
 		 471 aa  250  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  30.28 
 
 		 692 aa  237  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  37.73 
 
 		 447 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  35.02 
 
 		 466 aa  216  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  35.5 
 
 		 466 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  35.29 
 
 		 466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  35.62 
 
 		 487 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  38.08 
 
 		 479 aa  213  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  39.4 
 
 		 471 aa  212  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  34.46 
 
 		 458 aa  212  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  37.76 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 541 aa  207  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 541 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  36.06 
 
 		 445 aa  200  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  37.18 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  37.18 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  37.18 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  37.18 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  38.78 
 
 		 468 aa  196  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  35.4 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  35.63 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  36.91 
 
 		 474 aa  190  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  34.49 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.01 
 
 		 477 aa  187  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36 
 
 		 473 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.67 
 
 		 452 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.06 
 
 		 476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  30.65 
 
 		 781 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  32.9 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.11 
 
 		 453 aa  177  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.59 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.59 
 
 		 457 aa  174  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  34.99 
 
 		 477 aa  170  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.85 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  33.25 
 
 		 467 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  33.25 
 
 		 467 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  33.25 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  35.02 
 
 		 468 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 465 aa  167  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  35.02 
 
 		 468 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.25 
 
 		 457 aa  164  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.57 
 
 		 468 aa  161  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.27 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  35.03 
 
 		 441 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  35.03 
 
 		 441 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  33.51 
 
 		 454 aa  158  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.41 
 
 		 499 aa  157  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.41 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.16 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  31.88 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.16 
 
 		 455 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  31.75 
 
 		 495 aa  153  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.57 
 
 		 456 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.08 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  30.71 
 
 		 477 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 454 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 454 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  31.52 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.57 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.12 
 
 		 473 aa  144  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.25 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.57 
 
 		 502 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4396  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.92 
 
 		 482 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.446586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  34 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  30.68 
 
 		 474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.56 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  28.81 
 
 		 442 aa  135  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0835  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.65 
 
 		 664 aa  134  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.17 
 
 		 471 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.02 
 
 		 470 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.52 
 
 		 500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.77 
 
 		 451 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  27.23 
 
 		 446 aa  127  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.61 
 
 		 451 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.35 
 
 		 448 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0213  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 543 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.878749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  27.25 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0114  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.18 
 
 		 852 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.16 
 
 		 478 aa  122  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.28 
 
 		 477 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  28.78 
 
 		 452 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  33.5 
 
 		 505 aa  120  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>