220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1449 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  100 
 
 
781 aa  1538    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  30.94 
 
 
677 aa  209  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  29.96 
 
 
668 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  28.54 
 
 
669 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  29.36 
 
 
692 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  30.15 
 
 
665 aa  177  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.98 
 
 
657 aa  173  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.2 
 
 
457 aa  168  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  32.81 
 
 
458 aa  165  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.35 
 
 
456 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  30.87 
 
 
685 aa  162  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  31.05 
 
 
456 aa  161  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.98 
 
 
680 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.98 
 
 
680 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  34.74 
 
 
445 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.47 
 
 
678 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.47 
 
 
678 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.97 
 
 
456 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.95 
 
 
454 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  29.95 
 
 
454 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.69 
 
 
454 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.54 
 
 
453 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.83 
 
 
473 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.1 
 
 
456 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  29.81 
 
 
454 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.38 
 
 
472 aa  147  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.81 
 
 
451 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.54 
 
 
456 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.67 
 
 
447 aa  146  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.4 
 
 
452 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.08 
 
 
455 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.92 
 
 
457 aa  144  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.43 
 
 
477 aa  143  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.88 
 
 
458 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.03 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  30.87 
 
 
458 aa  142  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.88 
 
 
454 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  28.44 
 
 
541 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  31.71 
 
 
477 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.5 
 
 
457 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  29.67 
 
 
490 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.25 
 
 
482 aa  138  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  27.96 
 
 
541 aa  137  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  30.05 
 
 
498 aa  137  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  28.47 
 
 
507 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  28.47 
 
 
507 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0213  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.62 
 
 
543 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.878749  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  28.22 
 
 
507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  28.22 
 
 
507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  28.22 
 
 
507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  28.22 
 
 
507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  28.22 
 
 
507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  29.7 
 
 
474 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  31.71 
 
 
465 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  27.48 
 
 
513 aa  128  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.48 
 
 
462 aa  126  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  30.92 
 
 
469 aa  126  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  29.52 
 
 
448 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.54 
 
 
476 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  29.21 
 
 
472 aa  125  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.53 
 
 
470 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  29.23 
 
 
441 aa  124  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  29.16 
 
 
504 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.16 
 
 
504 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.87 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.61 
 
 
448 aa  122  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  26.83 
 
 
488 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  30.29 
 
 
452 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.88 
 
 
500 aa  120  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  28.5 
 
 
471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.39 
 
 
448 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  29.02 
 
 
456 aa  119  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.29 
 
 
468 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.51 
 
 
499 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  31.2 
 
 
471 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  32 
 
 
468 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  32 
 
 
468 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  32 
 
 
468 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  32 
 
 
468 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.85 
 
 
502 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.34 
 
 
504 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  25.93 
 
 
487 aa  115  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.5 
 
 
502 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  28.24 
 
 
502 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.24 
 
 
502 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  29.9 
 
 
437 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  27.62 
 
 
500 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  28.07 
 
 
445 aa  114  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  29.83 
 
 
466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  29.75 
 
 
466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0835  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.71 
 
 
664 aa  112  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  29.14 
 
 
442 aa  111  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  29.46 
 
 
466 aa  111  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0092  flagellar hook-associated protein  29.37 
 
 
506 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3871  flagellar hook-associated protein  29.37 
 
 
506 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.8 
 
 
475 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.39 
 
 
487 aa  110  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  29.11 
 
 
506 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3953  flagellar hook-associated protein  29.11 
 
 
506 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3101  flagellar hook-associated protein 2  29.11 
 
 
506 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>