223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2865 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  100 
 
 
477 aa  945    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  44.17 
 
 
479 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  40.68 
 
 
479 aa  307  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  39.39 
 
 
495 aa  289  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  38.03 
 
 
473 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  39.07 
 
 
447 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4396  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.08 
 
 
482 aa  247  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.446586  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.05 
 
 
477 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  34.84 
 
 
490 aa  227  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.84 
 
 
478 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  39.7 
 
 
669 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  34.16 
 
 
458 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.2 
 
 
452 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.65 
 
 
477 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  34.91 
 
 
488 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  35.23 
 
 
668 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.31 
 
 
482 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  32.02 
 
 
454 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  32.72 
 
 
498 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.81 
 
 
454 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  32.29 
 
 
445 aa  190  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  34.99 
 
 
665 aa  189  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  30.53 
 
 
487 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  32.57 
 
 
465 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.11 
 
 
476 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  34.18 
 
 
677 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.15 
 
 
456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.46 
 
 
457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  28.32 
 
 
541 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.04 
 
 
456 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.73 
 
 
456 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  27.96 
 
 
541 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  31.11 
 
 
454 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  31.73 
 
 
452 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.4 
 
 
453 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  31.08 
 
 
471 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  32.3 
 
 
468 aa  176  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.3 
 
 
468 aa  176  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  32.3 
 
 
468 aa  176  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  32.3 
 
 
468 aa  176  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  32.3 
 
 
468 aa  176  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  32.91 
 
 
441 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.69 
 
 
457 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.4 
 
 
455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.94 
 
 
468 aa  173  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.8 
 
 
454 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  30.35 
 
 
458 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.48 
 
 
451 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.8 
 
 
454 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30 
 
 
457 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.86 
 
 
680 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.86 
 
 
680 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.87 
 
 
456 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  29.25 
 
 
456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  30.88 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  30.88 
 
 
468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.38 
 
 
462 aa  163  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  31.72 
 
 
477 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  29.71 
 
 
471 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  33.92 
 
 
685 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30 
 
 
470 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.2 
 
 
502 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  30.83 
 
 
466 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  30.83 
 
 
466 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.68 
 
 
678 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.68 
 
 
678 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30 
 
 
487 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  30.63 
 
 
466 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  29.09 
 
 
469 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  30.93 
 
 
452 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.68 
 
 
500 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.81 
 
 
465 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.23 
 
 
502 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  32.02 
 
 
502 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.02 
 
 
502 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.8 
 
 
472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.39 
 
 
499 aa  143  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  30.1 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  30.1 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  30.1 
 
 
467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.64 
 
 
475 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.64 
 
 
473 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  27.65 
 
 
441 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  27.65 
 
 
441 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  29.55 
 
 
474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  28.28 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  27.62 
 
 
487 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  27.77 
 
 
456 aa  133  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.96 
 
 
504 aa  133  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  30.55 
 
 
781 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.12 
 
 
472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  27.65 
 
 
692 aa  130  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.27 
 
 
471 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  29.55 
 
 
504 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.55 
 
 
504 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  29.33 
 
 
500 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  30.74 
 
 
472 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.72 
 
 
657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.3 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  29.46 
 
 
492 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>