212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01000 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  100 
 
 
441 aa  854    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  100 
 
 
441 aa  854    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.08 
 
 
454 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.08 
 
 
454 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  34.39 
 
 
456 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.88 
 
 
447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.63 
 
 
468 aa  197  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.33 
 
 
456 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  35.28 
 
 
454 aa  196  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.26 
 
 
457 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.11 
 
 
456 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.42 
 
 
456 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.21 
 
 
475 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.13 
 
 
457 aa  186  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.99 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.77 
 
 
475 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.65 
 
 
456 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  32.19 
 
 
454 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.13 
 
 
452 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.66 
 
 
457 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.95 
 
 
453 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  30.75 
 
 
500 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  31.82 
 
 
471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.93 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  32 
 
 
472 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  32.18 
 
 
502 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.18 
 
 
502 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  31.42 
 
 
507 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  31.42 
 
 
507 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.13 
 
 
487 aa  169  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.97 
 
 
502 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  31.42 
 
 
507 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.76 
 
 
472 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  31.42 
 
 
507 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  31.42 
 
 
507 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  31.21 
 
 
507 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  31.42 
 
 
507 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  31 
 
 
513 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.86 
 
 
454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  31.94 
 
 
474 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  31.49 
 
 
487 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  30.93 
 
 
490 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.21 
 
 
455 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.33 
 
 
477 aa  161  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  34.29 
 
 
677 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  32.39 
 
 
466 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  30.63 
 
 
498 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  30.87 
 
 
458 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  32.17 
 
 
466 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  33.65 
 
 
669 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  32.19 
 
 
466 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.4 
 
 
479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.47 
 
 
502 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  34.26 
 
 
665 aa  152  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  31.42 
 
 
452 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  30.44 
 
 
487 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  32.09 
 
 
668 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.96 
 
 
504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  30.84 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.09 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  30.33 
 
 
504 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.33 
 
 
504 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  29.57 
 
 
478 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.53 
 
 
500 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.91 
 
 
505 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3197  flagellar hook-associated protein 2  30.74 
 
 
508 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.13 
 
 
471 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  29.7 
 
 
505 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  30.17 
 
 
452 aa  143  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  29.98 
 
 
477 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3953  flagellar hook-associated protein  30.21 
 
 
506 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0092  flagellar hook-associated protein  30.21 
 
 
506 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.2 
 
 
482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3871  flagellar hook-associated protein  30.21 
 
 
506 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.09 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  29.52 
 
 
541 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  30 
 
 
506 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3449  flagellar hook-associated protein 2  30 
 
 
506 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0369122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1670  flagellar hook-associated protein 2  30 
 
 
506 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3101  flagellar hook-associated protein 2  30 
 
 
506 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.57 
 
 
657 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  30.04 
 
 
492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  28.95 
 
 
541 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  30.02 
 
 
488 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.35 
 
 
473 aa  136  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.94 
 
 
476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  29.8 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.48 
 
 
479 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  29.7 
 
 
484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  25.45 
 
 
445 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  30.31 
 
 
445 aa  130  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  27.49 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.27 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  30.72 
 
 
465 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.71 
 
 
462 aa  126  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  25.57 
 
 
442 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.88 
 
 
463 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  25 
 
 
437 aa  123  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  30 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.33 
 
 
478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>