226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2365 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  100 
 
 
677 aa  1347    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  44.97 
 
 
669 aa  504  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  42.94 
 
 
665 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  38.88 
 
 
668 aa  445  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.24 
 
 
657 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  35.56 
 
 
685 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.32 
 
 
680 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.32 
 
 
680 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.05 
 
 
678 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.05 
 
 
678 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  32.71 
 
 
692 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.04 
 
 
477 aa  244  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.03 
 
 
476 aa  238  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  32.78 
 
 
541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  38.04 
 
 
468 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  32.78 
 
 
541 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  39.07 
 
 
490 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  38.21 
 
 
453 aa  231  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  39.47 
 
 
498 aa  229  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  41.67 
 
 
458 aa  229  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  38.06 
 
 
482 aa  226  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  37.56 
 
 
447 aa  226  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  38.62 
 
 
456 aa  225  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  36.22 
 
 
454 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.01 
 
 
451 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.83 
 
 
479 aa  220  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  36.8 
 
 
458 aa  218  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.06 
 
 
457 aa  218  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.36 
 
 
454 aa  216  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.52 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  30.94 
 
 
781 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  36.19 
 
 
487 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.28 
 
 
454 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.28 
 
 
454 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  37 
 
 
474 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.88 
 
 
456 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  36.48 
 
 
456 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  36.57 
 
 
456 aa  206  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  36.72 
 
 
488 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  34.95 
 
 
454 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  37.44 
 
 
452 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.47 
 
 
487 aa  200  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.61 
 
 
462 aa  200  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.02 
 
 
456 aa  200  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.11 
 
 
457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  35.27 
 
 
495 aa  197  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.43 
 
 
502 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.66 
 
 
455 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  36.18 
 
 
502 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.18 
 
 
502 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  37.56 
 
 
445 aa  191  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  34.88 
 
 
465 aa  188  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  33.67 
 
 
487 aa  187  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  33.16 
 
 
471 aa  183  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  34.77 
 
 
471 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.55 
 
 
465 aa  177  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  34.16 
 
 
500 aa  177  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.39 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.91 
 
 
470 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  34.39 
 
 
468 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  34.39 
 
 
468 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  34.39 
 
 
468 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  34.15 
 
 
468 aa  174  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.57 
 
 
471 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  32.18 
 
 
452 aa  173  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  33.59 
 
 
441 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  35.8 
 
 
468 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  35.8 
 
 
468 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  33.99 
 
 
466 aa  171  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  34.08 
 
 
478 aa  170  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  33 
 
 
466 aa  170  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.57 
 
 
500 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  32.76 
 
 
466 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  32.93 
 
 
477 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  34.18 
 
 
477 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  31.42 
 
 
469 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  33.75 
 
 
505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.25 
 
 
505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  34.29 
 
 
441 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  34.29 
 
 
441 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  32.08 
 
 
513 aa  163  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3197  flagellar hook-associated protein 2  36.07 
 
 
508 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.57 
 
 
479 aa  162  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  31.83 
 
 
507 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  31.83 
 
 
507 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  31.83 
 
 
507 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  31.83 
 
 
507 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  31.83 
 
 
507 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  31.83 
 
 
507 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  31.58 
 
 
507 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  33.99 
 
 
467 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  33.99 
 
 
467 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0213  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.03 
 
 
543 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.878749  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  33.99 
 
 
467 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.92 
 
 
473 aa  157  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0092  flagellar hook-associated protein  35.32 
 
 
506 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3871  flagellar hook-associated protein  35.32 
 
 
506 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.76 
 
 
473 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  35.07 
 
 
506 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3101  flagellar hook-associated protein 2  35.07 
 
 
506 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>