225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4376 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  100 
 
 		 452 aa  882    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  47.52 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  44.88 
 
 		 471 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  41.82 
 
 		 492 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  43.88 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3464  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  44.65 
 
 		 483 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  42.41 
 
 		 470 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  38.19 
 
 		 487 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  35.94 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  36.36 
 
 		 474 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.48 
 
 		 456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.41 
 
 		 456 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.83 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.48 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.12 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  33.04 
 
 		 456 aa  203  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.18 
 
 		 454 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.97 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.75 
 
 		 453 aa  189  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.17 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  31.43 
 
 		 454 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.15 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.14 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.43 
 
 		 476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.02 
 
 		 456 aa  183  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  31.32 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  28.75 
 
 		 486 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.84 
 
 		 447 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  28.89 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  30.08 
 
 		 468 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.82 
 
 		 455 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  30.08 
 
 		 468 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.44 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  31.09 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.1 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  30 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  31.42 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  31.42 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  31.2 
 
 		 458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  32.56 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  29.79 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.45 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.38 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  35.56 
 
 		 668 aa  156  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 475 aa  156  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  30.25 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  31.68 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  31.33 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  30.06 
 
 		 487 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.26 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  28.27 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  29.45 
 
 		 441 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  32.63 
 
 		 466 aa  150  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  32.63 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  30.2 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  28.69 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  28.69 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  28.69 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.6 
 
 		 478 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  32.2 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.26 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  30.66 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  30.44 
 
 		 468 aa  143  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  30.44 
 
 		 468 aa  143  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  30.44 
 
 		 468 aa  143  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  30.65 
 
 		 488 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.41 
 
 		 482 aa  143  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  30.52 
 
 		 505 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.5 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  31.41 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.07 
 
 		 680 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.65 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.07 
 
 		 680 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  27.54 
 
 		 487 aa  140  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.16 
 
 		 678 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.16 
 
 		 678 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.03 
 
 		 657 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  32.42 
 
 		 452 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  31.28 
 
 		 677 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  30.17 
 
 		 498 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.8 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.61 
 
 		 500 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2912  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.82 
 
 		 577 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.66 
 
 		 502 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  31.14 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  28.6 
 
 		 502 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.6 
 
 		 502 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  30.96 
 
 		 685 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.1 
 
 		 477 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  25.36 
 
 		 471 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.57 
 
 		 473 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  26.59 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  31.55 
 
 		 541 aa  124  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  28.51 
 
 		 500 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  29.19 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.16 
 
 		 479 aa  123  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.98 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>