210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1529 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  100 
 
 		 484 aa  937    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  49.28 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  49.3 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3464  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  49.09 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  46.69 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  43.88 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.47 
 
 		 463 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.9 
 
 		 487 aa  247  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  34.16 
 
 		 477 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.32 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  33.96 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.79 
 
 		 454 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.79 
 
 		 454 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  33.82 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.26 
 
 		 456 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.08 
 
 		 456 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.85 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.66 
 
 		 456 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  33.33 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  31.93 
 
 		 454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.8 
 
 		 456 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.07 
 
 		 451 aa  179  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.88 
 
 		 468 aa  177  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.66 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.71 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  32.9 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.4 
 
 		 505 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  32.4 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.29 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  28.95 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  30.72 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.13 
 
 		 475 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  34.95 
 
 		 668 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  34.06 
 
 		 502 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.06 
 
 		 502 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.81 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.86 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.67 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.7 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  31.74 
 
 		 445 aa  151  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  29.29 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  30.6 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  30.6 
 
 		 468 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  32.71 
 
 		 677 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.69 
 
 		 462 aa  146  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  30.1 
 
 		 471 aa  146  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  29.94 
 
 		 500 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  30.71 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.27 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  29.07 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.1 
 
 		 479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  35.8 
 
 		 669 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  31.7 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  29.7 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  29.7 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  29.67 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  31.67 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  29.28 
 
 		 467 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  29.07 
 
 		 467 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  29.07 
 
 		 467 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  31.27 
 
 		 504 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.27 
 
 		 504 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.46 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.11 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  26.63 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.51 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  29.46 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  29.46 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  29.46 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  32.35 
 
 		 472 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.27 
 
 		 504 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  30.77 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  29.01 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  29.01 
 
 		 466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  29.24 
 
 		 466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  29.69 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.86 
 
 		 482 aa  128  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  26.1 
 
 		 471 aa  126  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  29.54 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.07 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  27.49 
 
 		 507 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  27.49 
 
 		 507 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  27.49 
 
 		 507 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  27.49 
 
 		 507 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  27.49 
 
 		 507 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  27.49 
 
 		 507 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.13 
 
 		 657 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  27.29 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.34 
 
 		 465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  28.63 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  27.38 
 
 		 513 aa  118  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.22 
 
 		 499 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3197  flagellar hook-associated protein 2  30.82 
 
 		 508 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  30.89 
 
 		 541 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  27.05 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.44 
 
 		 473 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3953  flagellar hook-associated protein  30.48 
 
 		 506 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  30.48 
 
 		 506 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>