218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4094 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
473 aa  932    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  64.18 
 
 
487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  52.01 
 
 
469 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.26 
 
 
447 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.4 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  35.5 
 
 
665 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  33.6 
 
 
471 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  33.89 
 
 
445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  33.26 
 
 
458 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.56 
 
 
451 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.28 
 
 
477 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.84 
 
 
451 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  33.05 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  35.54 
 
 
669 aa  183  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.36 
 
 
657 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.36 
 
 
452 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  34.16 
 
 
677 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  31.45 
 
 
458 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.2 
 
 
482 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  29.55 
 
 
487 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  30.46 
 
 
442 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.9 
 
 
456 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  30.56 
 
 
490 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  31.09 
 
 
441 aa  160  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  31.09 
 
 
441 aa  160  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.28 
 
 
457 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.75 
 
 
453 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  29.49 
 
 
454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  29.03 
 
 
456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.81 
 
 
471 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  32.85 
 
 
466 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.19 
 
 
457 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.59 
 
 
451 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.07 
 
 
479 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  29.13 
 
 
541 aa  150  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  30.96 
 
 
441 aa  150  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  32.43 
 
 
466 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  30.6 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  28.87 
 
 
541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.13 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  32.43 
 
 
466 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.72 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  30.08 
 
 
498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  32.12 
 
 
668 aa  146  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.85 
 
 
455 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.95 
 
 
457 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  30.58 
 
 
465 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.04 
 
 
476 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.58 
 
 
454 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  30.02 
 
 
488 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.66 
 
 
487 aa  143  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.17 
 
 
448 aa  143  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.58 
 
 
454 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.24 
 
 
456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.06 
 
 
454 aa  141  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  30.63 
 
 
632 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.75 
 
 
470 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0765  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.25 
 
 
443 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  29.71 
 
 
452 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  30.92 
 
 
446 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  27.97 
 
 
454 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  30.25 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.48 
 
 
456 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  29.2 
 
 
468 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  28.72 
 
 
474 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  29.17 
 
 
468 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.75 
 
 
468 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.98 
 
 
472 aa  133  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.86 
 
 
479 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  29.54 
 
 
471 aa  133  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  29.55 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.78 
 
 
680 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  29.55 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  29.55 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.78 
 
 
680 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  29.26 
 
 
456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.22 
 
 
449 aa  129  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.59 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.07 
 
 
479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.36 
 
 
502 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.84 
 
 
444 aa  127  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  30.36 
 
 
502 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.36 
 
 
502 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  25.71 
 
 
471 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27 
 
 
465 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3015  flagellar capping protein  26.95 
 
 
528 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  28.87 
 
 
477 aa  123  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  28.68 
 
 
500 aa  123  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  26.94 
 
 
474 aa  123  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  30 
 
 
692 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.43 
 
 
473 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  27.88 
 
 
781 aa  121  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  31.22 
 
 
685 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  26.86 
 
 
495 aa  120  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.52 
 
 
505 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  29.83 
 
 
472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.32 
 
 
678 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.32 
 
 
678 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  29.31 
 
 
484 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.05 
 
 
473 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>