219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4396 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4396  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
482 aa  940    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.446586  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  49.59 
 
 
477 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  46.22 
 
 
478 aa  362  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  44.38 
 
 
479 aa  336  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  40.52 
 
 
495 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  39.18 
 
 
473 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.55 
 
 
479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  37.76 
 
 
477 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.43 
 
 
447 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.94 
 
 
452 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  32.34 
 
 
490 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.11 
 
 
468 aa  163  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  30.38 
 
 
441 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  32.73 
 
 
498 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.3 
 
 
451 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.09 
 
 
455 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.31 
 
 
477 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  29.58 
 
 
458 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.94 
 
 
462 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  29.81 
 
 
458 aa  159  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  31.92 
 
 
665 aa  156  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.85 
 
 
482 aa  157  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  30.43 
 
 
445 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.3 
 
 
454 aa  153  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  29.33 
 
 
541 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  30.67 
 
 
669 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  29.19 
 
 
541 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  29.47 
 
 
471 aa  150  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  29.19 
 
 
469 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  30.04 
 
 
466 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  31.87 
 
 
677 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  29.55 
 
 
466 aa  147  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  28.63 
 
 
487 aa  147  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  29.84 
 
 
466 aa  146  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.8 
 
 
453 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  29.78 
 
 
668 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  29.82 
 
 
452 aa  143  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.5 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  29.01 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  27.78 
 
 
454 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  26.92 
 
 
454 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.09 
 
 
456 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  29.86 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  28.81 
 
 
456 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.25 
 
 
657 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  29.42 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.42 
 
 
468 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.6 
 
 
472 aa  133  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  29.42 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  29.42 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.12 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.87 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  29.42 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  29.78 
 
 
488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  28.66 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  27.18 
 
 
487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.62 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.25 
 
 
456 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.47 
 
 
454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.47 
 
 
454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.79 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  26.61 
 
 
467 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.84 
 
 
451 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  26.61 
 
 
467 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.06 
 
 
451 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  26.61 
 
 
467 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.43 
 
 
465 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  29.66 
 
 
452 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  28.63 
 
 
471 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  27.44 
 
 
474 aa  124  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  26.01 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.63 
 
 
680 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.63 
 
 
680 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  26.01 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  29.26 
 
 
441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  29.26 
 
 
441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.6 
 
 
473 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.52 
 
 
502 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  28.19 
 
 
477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  29.57 
 
 
685 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.84 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  29.52 
 
 
502 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.52 
 
 
502 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  26.83 
 
 
442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  28.96 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.78 
 
 
475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  21.88 
 
 
476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  27.31 
 
 
478 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  27.46 
 
 
692 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  26.65 
 
 
452 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.22 
 
 
472 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.4 
 
 
505 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.84 
 
 
500 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.67 
 
 
475 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  28.8 
 
 
505 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.55 
 
 
463 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.8 
 
 
471 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  29.24 
 
 
446 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  28.06 
 
 
462 aa  100  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.76 
 
 
678 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>