106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1500 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1500  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 		 591 aa  1192    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0400  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  49.66 
 
 		 594 aa  562  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.157699  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1693  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  46.45 
 
 		 611 aa  481  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1623  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  45.95 
 
 		 607 aa  476  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0353  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  38.9 
 
 		 502 aa  246  6.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1783  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.43 
 
 		 606 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2418  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.88 
 
 		 612 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  25.62 
 
 		 632 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  28.34 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3015  flagellar capping protein  27.98 
 
 		 528 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.87 
 
 		 462 aa  102  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0444  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.66 
 
 		 587 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2218  flagellar hook-associated 2-like protein  26.48 
 
 		 838 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0105  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.27 
 
 		 778 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.59 
 
 		 504 aa  87.4  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1653  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.18 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.4 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4166  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.52 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.02 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.87 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.43 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0464  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.79 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0442639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.09 
 
 		 456 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  32.67 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.71 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.93 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  26.6 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.63 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  24.5 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.89 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  26.96 
 
 		 474 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2119  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.7 
 
 		 575 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  26.23 
 
 		 441 aa  62  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03169  flagellar capping protein  27.17 
 
 		 670 aa  61.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.88 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  25.55 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.42 
 
 		 479 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002808  flagellar hook-associated protein FliD  25.41 
 
 		 663 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  27.75 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.46 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.54 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.58 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0807  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.5 
 
 		 831 aa  58.5  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2315  flagellar capping protein  25.77 
 
 		 646 aa  58.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0994  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.29 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.864471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  27.34 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0312  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 		 691 aa  57.4  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0197  flagellar capping protein-like protein  28.3 
 
 		 893 aa  57  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  25.89 
 
 		 454 aa  57  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  34.95 
 
 		 452 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  33.68 
 
 		 665 aa  56.6  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  27.78 
 
 		 441 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  25.22 
 
 		 456 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3464  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  25.22 
 
 		 483 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  26.85 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.58 
 
 		 454 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.58 
 
 		 454 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0800  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.32 
 
 		 500 aa  55.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.25 
 
 		 478 aa  54.7  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1724  flagellar capping protein  23.83 
 
 		 666 aa  54.7  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0724566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2912  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.92 
 
 		 577 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1472  flagellar hook-associated protein FliD  26.34 
 
 		 652 aa  54.3  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  28.44 
 
 		 685 aa  52.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.73 
 
 		 479 aa  52.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 470 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.42 
 
 		 458 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.43 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1120  flagellar hook-associated protein 2, putative  28.3 
 
 		 575 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.176879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  32.67 
 
 		 452 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.43 
 
 		 452 aa  51.6  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  24.65 
 
 		 486 aa  50.8  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  25.65 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.59 
 
 		 477 aa  49.3  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.53 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.12 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.68 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  22.73 
 
 		 488 aa  48.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.45 
 
 		 449 aa  48.5  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4396  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.83 
 
 		 482 aa  48.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.446586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.68 
 
 		 451 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.93 
 
 		 680 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2229  flagellar hook-associated 2 domain protein  22.49 
 
 		 531 aa  47.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000532748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.93 
 
 		 680 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  21.74 
 
 		 453 aa  47.4  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  29.07 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0765  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.06 
 
 		 443 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  30.6 
 
 		 471 aa  46.2  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.01 
 
 		 468 aa  46.2  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  23.85 
 
 		 456 aa  45.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  25.89 
 
 		 477 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  24.04 
 
 		 677 aa  45.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0733  flagellar hook-associated 2 domain protein  19.72 
 
 		 734 aa  44.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  22.52 
 
 		 444 aa  44.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4660  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.61 
 
 		 453 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  23.72 
 
 		 452 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  24.62 
 
 		 541 aa  43.9  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.13 
 
 		 473 aa  43.9  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>